RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRPP02741 224 aa5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGF6P10767 208 aa5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCER1GP30273 86 aa5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ORMDL3Q8N138 153 aa5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRELID3AQ96N28 172 aa5.4□□□□□ -1.54
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HERC2O95714 4834 aa5.4□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C16orf90A8MZG2 172 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HLA-DQA1P01909 254 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ESDP10768 282 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S100PP25815 95 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELOBQ15370 118 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RHEBQ15382 184 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.39□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXCL5P42830 114 aa5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFA5Q16718 116 aa5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SVBPQ8N300 66 aa5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C20orf78Q9BR46 151 aa5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R17O96001 155 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPBPP02775 128 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PKIAP61925 76 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR34Q9NV39 138 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0J9YXV3 536 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HAMPP81172 84 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q0VG73 95 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FABP9Q0Z7S8 132 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIAQ16674 131 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZUT4 128 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N814 137 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RMI2Q96E14 147 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP1LC3AQ9H492 121 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP10-1P60331 282 aa5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 XCL1P47992 114 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2AP49459 152 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8N8P6 123 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YPEL4Q96NS1 127 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa5.34□□□□□ -1.55
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAT1Q14517 4588 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCL25O15444 150 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCO1O75880 301 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM104AQ969W3 186 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.33□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H0Y9J4 135 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00526Q96FQ7 95 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.32□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C15orf56Q8N910 161 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.31□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT-ND6P03923 174 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PMCHL1Q16048 86 aa5.3□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX19Q49B96 90 aa5.29□□□□□ -1.56
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 C5orf38Q86SI9 138 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIMM17AQ99595 171 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPANXA1Q9NS26 97 aa5.29□□□□□ -1.56
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.29□□□□□ -1.56
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGIPA6NJ69 53 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRGC2P03986 189 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX6A2Q02221 97 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCP2Q8IVA1 136 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM141Q96I45 108 aa5.27□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A096LNJ9 63 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COLCA2A8K830 154 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf196B1AJZ1 125 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX7A2LO14548 114 aa5.26□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C5orf47Q569G3 176 aa5.26□□□□□ -1.57
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