RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 PRR4Q16378 134 aa7.02□□□□□ -1.29
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GARNL3-210ENST00000453030 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.01□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 RAB5BP61020 215 aa7□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H2BJP06899 126 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H2BOP23527 126 aa6.99□□□□□ -1.29
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GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H2BDP58876 126 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H2BCP62807 126 aa6.99□□□□□ -1.29
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GARNL3-210ENST00000453030 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 LCE2CQ5TA81 110 aa6.99□□□□□ -1.29
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GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM141Q96I45 108 aa6.99□□□□□ -1.29
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GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.99□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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GARNL3-210ENST00000453030 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.98□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.98□□□□□ -1.29
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GARNL3-210ENST00000453030 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.97□□□□□ -1.29
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 BAGE3Q86Y29 109 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.96□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF861PO60384 105 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 CKS1BP61024 79 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZN92 141 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.95□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.95□□□□□ -1.3
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GARNL3-210ENST00000453030 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 C22orf24Q9Y442 160 aa6.94□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 NUPR1O60356 82 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 VCX2Q9H322 139 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.93□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 SERF1AO75920 110 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.92□□□□□ -1.3
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GARNL3-210ENST00000453030 Q8IZM0 81 aa6.92□□□□□ -1.3
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GARNL3-210ENST00000453030 AMELXQ99217 191 aa6.92□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 A0A087X002 238 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00310P59036 64 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 PMCHL1Q16048 86 aa6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 A0A0U1RQV1 116 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 PRSS47A8MTI9 375 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00614P0C842 121 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.9□□□□□ -1.3
GARNL3-210ENST00000453030 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.9□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 IGIPA6NJ69 53 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 F8VRH5 84 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 HERVK_113P63121 156 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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GARNL3-210ENST00000453030 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.88□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 NPSP0C0P6 89 aa6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 CRYGAP11844 174 aa6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 S100A2P29034 98 aa6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 SEC11AP67812 179 aa6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.87□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 FABP4P15090 132 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 CXCL5P42830 114 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00167Q96N53 147 aa6.86□□□□□ -1.31
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.85□□□□□ -1.31
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