RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 LPAP08519 4548 aa12.65□□□□□ -0.38
LIMS1-208ENST00000428064 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.64□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.64□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 UQCC3Q6UW78 93 aa12.63□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 TOMM6Q96B49 74 aa12.63□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.62□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM218A2RU14 115 aa12.61□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 F8VRH5 84 aa12.61□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 NUPR1O60356 82 aa12.6□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL5P42830 114 aa12.6□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa12.59□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 ERASQ7Z444 233 aa12.59□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 C22orf24Q9Y442 160 aa12.59□□□□□ -0.39
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01549A6NIU2 74 aa12.58□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF861PO60384 105 aa12.58□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00469Q8N7U9 141 aa12.58□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.58□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.57□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 COMMD7Q86VX2 200 aa12.57□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 SEC11CQ9BY50 192 aa12.56□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.56□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.55□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01546A6NGU7 62 aa12.55□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa12.54□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.54□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 S100PP25815 95 aa12.54□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 PDZD11Q5EBL8 140 aa12.54□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 SCGB3A1Q96QR1 104 aa12.54□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
LIMS1-208ENST00000428064 GNB1LQ9BYB4 327 aa12.52□□□□□ -0.41
LIMS1-208ENST00000428064 COX7B2Q8TF08 81 aa12.5□□□□□ -0.41
LIMS1-208ENST00000428064 BCE1O60756 84 aa12.49□□□□□ -0.41
LIMS1-208ENST00000428064 RPL28P46779 137 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
LIMS1-208ENST00000428064 CST9LQ9H4G1 147 aa12.48□□□□□ -0.41
LIMS1-208ENST00000428064 COX19Q49B96 90 aa12.47□□□□□ -0.41
LIMS1-208ENST00000428064 RPS10P5Q9NQ39 176 aa12.47□□□□□ -0.41
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.46□□□□□ -0.41
LIMS1-208ENST00000428064 PMVKQ15126 192 aa12.46□□□□□ -0.41
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 RHEBQ15382 184 aa12.44□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00167Q96N53 147 aa12.44□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SPINK8P0C7L1 97 aa12.43□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf91Q5T1B1 145 aa12.43□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 FABP9Q0Z7S8 132 aa12.42□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 FA2HQ7L5A8 372 aa12.42□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 H3BRM9 83 aa12.41□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 PRR4Q16378 134 aa12.41□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 SMCO4Q9NRQ5 59 aa12.41□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087X002 238 aa12.4□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 RPL37AP8A6NKH3 93 aa12.4□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa12.4□□□□□ -0.42
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5LO75964 103 aa12.39□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 IGLC3P0DOY3 106 aa12.39□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.38□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 CRYGAP11844 174 aa12.38□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 RAB5BP61020 215 aa12.38□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.38□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 MUC2Q02817 5179 aa12.38□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 GAGE10A6NGK3 116 aa12.36□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 APOC3P02656 99 aa12.36□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 A0A096LNJ9 63 aa12.35□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 TYMSOSQ8TAI1 123 aa12.35□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.34□□□□□ -0.43
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2AP49459 152 aa12.33□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 COX17Q14061 63 aa12.33□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA5Q16718 116 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 FAM229BQ4G0N7 80 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa12.32□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 TSPAN13O95857 204 aa12.31□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 SFTA2Q6UW10 78 aa12.31□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 ERG28Q9UKR5 140 aa12.31□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 SNAPINO95295 136 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV2D-28P01615 120 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 HBDP02042 147 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00614P0C842 121 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 VPREB1P12018 145 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 PFN2P35080 140 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 SVBPQ8N300 66 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 C18orf32Q8TCD1 76 aa12.3□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa12.29□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.29□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA6P56556 154 aa12.28□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 RPL24P83731 157 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
LIMS1-208ENST00000428064 SCO1O75880 301 aa12.27□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 PMCHL1Q16048 86 aa12.27□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM126AQ9H061 195 aa12.26□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 ANAPC11Q9NYG5 84 aa12.26□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 CTAG1AP78358 180 aa12.25□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf86A6NJI1 115 aa12.24□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 PRLHP81277 87 aa12.23□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 M0R378 163 aa12.22□□□□□ -0.45
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM170BQ5T4T1 132 aa12.22□□□□□ -0.45
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