RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 Q8N3U1 123 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00482Q8N8I6 264 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 A0A087WZ39 114 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 PAX4O43316 350 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 TRACP01848 142 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRR-202ENST00000342084 Q6Q795 121 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 J3QKU1 62 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 C3orf56Q8N813 242 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 FAM110AQ9BQ89 295 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 LECT2O14960 151 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 HILS1P60008 231 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 FAM222AQ5U5X8 452 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRR-202ENST00000342084 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 DEFB135Q30KP9 77 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 DNAL4O96015 105 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 SS18Q15532 418 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 NCR3O14931 201 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 ACYP1P07311 99 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 PRO0255Q9UI72 69 aa5□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 Q8NDZ9 215 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 CELA1Q9UNI1 258 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 HTN3P15516 51 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00643Q86TS7 51 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 Q8IZM0 81 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRR-202ENST00000342084 A0A1B0GUV1 79 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 LY6G6DO95868 133 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA0087Q14695 138 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 C6orf223Q8N319 242 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 H0YGX0 51 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 REG3AQ06141 175 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 C10orf25Q5T742 122 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00846Q9NV44 126 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRR-202ENST00000342084 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 INAFM1C9JVW0 142 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 DAD1P61803 113 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 CXCL5P42830 114 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 A0A087WVE0 104 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 LYRM9A8MSI8 78 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 IMUPQ9GZP8 106 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 HIVEP1P15822 2718 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 NOTCH2Q04721 2471 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 SPAG11BQ08648 103 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 C6orf99Q4VX62 202 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 Q8N814 137 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 Q8NAQ8 132 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 KLK12Q9UKR0 248 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 APOC4P55056 127 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00167Q96N53 147 aa4.92□□□□□ -1.62
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