RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299240.10

TTC17-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC17, Length 3,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-202ENST00000299240 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
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TTC17-202ENST00000299240 TIRAPP58753 221 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC17-202ENST00000299240 SPAG11BQ08648 103 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC17-202ENST00000299240 C10orf25Q5T742 122 aa8.59□□□□□ -1.03
TTC17-202ENST00000299240 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.59□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 HIGD1BQ9P298 99 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.58□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 ENHOQ6UWT2 76 aa8.58□□□□□ -1.04
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TTC17-202ENST00000299240 A0A1W2PPM0 123 aa8.57□□□□□ -1.04
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TTC17-202ENST00000299240 UBE2V1Q13404 147 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 CASC10Q5T4H9 136 aa8.56□□□□□ -1.04
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TTC17-202ENST00000299240 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.56□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
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TTC17-202ENST00000299240 CLEC2BQ92478 149 aa8.55□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 PSCAO43653 123 aa8.55□□□□□ -1.04
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TTC17-202ENST00000299240 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 A0A087WZ39 114 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.54□□□□□ -1.04
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TTC17-202ENST00000299240 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.54□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 NDUFA1O15239 70 aa8.53□□□□□ -1.04
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TTC17-202ENST00000299240 MIAQ16674 131 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 ETDBQ3ZM63 59 aa8.53□□□□□ -1.04
TTC17-202ENST00000299240 A0A1B0GUV1 79 aa8.52□□□□□ -1.05
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TTC17-202ENST00000299240 H7C423 109 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC17-202ENST00000299240 LITAFQ99732 161 aa8.5□□□□□ -1.05
TTC17-202ENST00000299240 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
TTC17-202ENST00000299240 C9JAW5 83 aa8.49□□□□□ -1.05
TTC17-202ENST00000299240 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.49□□□□□ -1.05
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TTC17-202ENST00000299240 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.49□□□□□ -1.05
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TTC17-202ENST00000299240 K7EP34 96 aa8.48□□□□□ -1.05
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TTC17-202ENST00000299240 Q6ZRU5 148 aa8.45□□□□□ -1.06
TTC17-202ENST00000299240 B9D2Q9BPU9 175 aa8.45□□□□□ -1.06
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TTC17-202ENST00000299240 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.44□□□□□ -1.06
TTC17-202ENST00000299240 HERV-K104P63124 156 aa8.43□□□□□ -1.06
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TTC17-202ENST00000299240 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.42□□□□□ -1.06
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TTC17-202ENST00000299240 IGKV2D-28P01615 120 aa8.41□□□□□ -1.06
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TTC17-202ENST00000299240 C15orf56Q8N910 161 aa8.37□□□□□ -1.07
TTC17-202ENST00000299240 FAM168BA1KXE4 195 aa8.36□□□□□ -1.07
TTC17-202ENST00000299240 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.36□□□□□ -1.07
TTC17-202ENST00000299240 A0A0B4J2C4 111 aa8.36□□□□□ -1.07
TTC17-202ENST00000299240 SLC25A20O43772 301 aa8.36□□□□□ -1.07
TTC17-202ENST00000299240 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
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