RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 X6R8D5 127 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2D-28P01615 120 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.15□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 M0R378 163 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 UPK3BQ9BT76 320 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 DMDP11532 3685 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 CDK2AP2O75956 126 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 SPEGQ15772 3267 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 INAFM1C9JVW0 142 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 USP17L23D6RBM5 183 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 LINC00575Q6W349 94 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.11□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.11□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.11□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 ENHOQ6UWT2 76 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 C2orf48Q96LS8 159 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 AKAP13Q12802 2813 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 LINC00846Q9NV44 126 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZQY7 126 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 NREPQ16612 68 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 H3BNG1 76 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 SVIPQ8NHG7 77 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-201ENST00000264345 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 SYCNQ0VAF6 134 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 BCE1O60756 84 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 A0A0J9YWU9 116 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 LINC00167Q96N53 147 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 SCXQ7RTU7 201 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 PIEZO1Q92508 2521 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 CRYGAP11844 174 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 SMR3AQ99954 134 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 PSCAO43653 123 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 FAM236CP0DP71 79 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 NDUFS5O43920 106 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 C6orf223Q8N319 242 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 CELA1Q9UNI1 258 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 Q8NAQ8 132 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 CR1P17927 2039 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0087Q14695 138 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 NDUFC1O43677 76 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 HIVEP2P31629 2446 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 MGAQ8IWI9 3026 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 CXCL6P80162 114 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 CFAP54Q96N23 3096 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 UBE2BP63146 152 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 SNURFQ9Y675 71 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 IGLV6-57P01721 117 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 BPY2O14599 106 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WVE0 104 aa6.02□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 MP68P56378 58 aa6.02□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZQT0 140 aa6.02□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.02□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 PRR34Q9NV39 138 aa6.02□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 COL6A3P12111 3177 aa6.02□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC3-201ENST00000264345 V9GYY9 64 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.2 ms