RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 A8MTW9 85 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 FHL2Q14192 279 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 NOTCH1P46531 2555 aa9.41□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV2D-28P01615 120 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 SS18Q15532 418 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 CFAP161Q6P656 301 aa9.4□□□□□ -0.9
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087WVE0 104 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.39□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM86BQ8N661 226 aa9.38□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa9.37□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.36□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 TRACP01848 142 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 M0QXV9 152 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV1-51P01701 117 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00643Q86TS7 51 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 C6orf223Q8N319 242 aa9.34□□□□□ -0.91
TMOD1-201ENST00000259365 MAST4O15021 2626 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 CXCL5P42830 114 aa9.33□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 DAD1P61803 113 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 STAB1Q9NY15 2570 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00846Q9NV44 126 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 KLK12Q9UKR0 248 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.32□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087WZ39 114 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GX51 115 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.31□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 ACYP1P07311 99 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 IL17DQ8TAD2 202 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 PRO0255Q9UI72 69 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 C6orf99Q4VX62 202 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.3□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 BAHCC1Q9P281 2608 aa9.29□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.29□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.29□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 hADV29S1A0JD25 119 aa9.29□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 H0YGX0 51 aa9.29□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 REG3AQ06141 175 aa9.29□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 Q6Q795 121 aa9.29□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 C22orf24Q9Y442 160 aa9.28□□□□□ -0.92
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.27□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 HILS1P60008 231 aa9.26□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.26□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 HAMPP81172 84 aa9.26□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 HIGD2BQ4VC39 106 aa9.26□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 C10orf25Q5T742 122 aa9.26□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 OVOL2Q9BRP0 275 aa9.26□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 COL6A5A8TX70 2615 aa9.25□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.25□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP10-3P60369 221 aa9.25□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.25□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 CELA1Q9UNI1 258 aa9.25□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.24□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.24□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 SPAG11BQ08648 103 aa9.24□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 INAFM1C9JVW0 142 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 ENHOQ6UWT2 76 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 SCXQ7RTU7 201 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 X6R8D5 127 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM126AQ9H061 195 aa9.21□□□□□ -0.93
TMOD1-201ENST00000259365 MGAM2Q2M2H8 2515 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 Q8N814 137 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 Q8IZM0 81 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 Q8NDZ9 215 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 RETNQ9HD89 108 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD1-201ENST00000259365 LY6G6DO95868 133 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.3 ms