RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	PRSS2	P07478	247 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PNKP-231	ENST00000640501	MIA	Q16674	131 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PNKP-231	ENST00000640501	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		5.84	□□□□□ -1.47
PNKP-231	ENST00000640501		F8W1H4	67 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501		H3BNG1	76 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	ATR	Q13535	2644 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501		K7EP13	123 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501		K7ERU9	68 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	COX6C	P09669	75 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	COX7B2	Q8TF08	81 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501		Q9H8V8	135 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	ERG28	Q9UKR5	140 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	CUBN	O60494	3623 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501		A4D1N5	150 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	PSMB2	P49721	201 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	RBX1	P62877	108 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	COX6A2	Q02221	97 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501		Q1RN00	199 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	LELP1	Q5T871	98 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	F8	P00451	2351 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501		A0A087WZ39	114 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501		J3QR89	54 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB4A	O15263	64 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	CFC1	P0CG37	223 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	HTN3	P15516	51 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	TSPAN13	O95857	204 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	CXCL5	P42830	114 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501		A0A096LPF7	62 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	MAL	P21145	153 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	LITAF	Q99732	161 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	CELA1	Q9UNI1	258 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PNKP-231	ENST00000640501	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	COX7A2L	O14548	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV3-33	P01772	117 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	CRP	P02741	224 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP10-11	P60412	298 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	CKS1B	P61024	79 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	REG3A	Q06141	175 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	CFAP161	Q6P656	301 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501		Q8IZM0	81 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	XCL1	P47992	114 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	ATXN8	Q156A1	80 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	VWF	P04275	2813 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501		H3BMG7	143 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00158	P58513	81 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	COX17	Q14061	63 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	C5orf38	Q86SI9	138 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501		G3V4G9	280 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501		H7C2G1	150 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	NPC2	P61916	151 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501		A0A0J9YWU9	116 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501		M0QXV9	152 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PNKP-231	ENST00000640501		A0A0U1RRA0	63 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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