RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768		A0A087WZ39	114 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	MGP	P08493	103 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	IFITM2	Q01629	132 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	LAGE3	Q14657	143 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	ENHO	Q6UWT2	76 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	GATD1	Q8NB37	220 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	ISOC2	Q96AB3	205 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768		V9GYV3	84 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MLH1-223	ENST00000616768		A0A087WWC5	75 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF727	A8MUV8	499 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768		F2Z2F3	143 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	ATRAID	Q6UW56	229 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	RNF185	Q96GF1	192 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	KLK12	Q9UKR0	248 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	HIGD1C	A8MV81	97 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	SMKR1	H3BMG3	65 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TRGC1	P0CF51	173 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	RBX1	P62877	108 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	RASL11A	Q6T310	242 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	NUP35	Q8NFH5	326 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TSKU	Q8WUA8	353 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	UBE2W	Q96B02	151 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	BIN3	Q9NQY0	253 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	OSTC	Q9NRP0	149 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GUT8	65 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GXF2	115 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	XKRY2	A2RUG3	117 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768		A8MWL6	223 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	NCR2	O95944	276 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM17	P0DL12	118 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	ADCYAP1	P18509	176 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	ADIRF	Q15847	76 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TPRXL	Q17RH7	258 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	AMN1	Q8IY45	258 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	NIT2	Q9NQR4	276 aa		2.81	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	RAB4A	P20338	218 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	CFAP161	Q6P656	301 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	FAM104A	Q969W3	186 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	NAT8	Q9UHE5	227 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	MDN1	Q9NU22	5596 aa		2.8	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768		A0A087WX48	190 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM262	E9PQX1	116 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	ESD	P10768	282 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	PEA15	Q15121	130 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	CLLU1	Q5K131	121 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	RMI2	Q96E14	147 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM243	Q9BU79	118 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		2.79	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	HLA-DQA1	P01909	254 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	REG3A	Q06141	175 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	COTL1	Q14019	142 aa		2.78	□□□□□ -1.96
MLH1-223	ENST00000616768	MIA	Q16674	131 aa		2.78	□□□□□ -1.96

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