RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRSS2P07478 247 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NPC2P61916 151 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LITAFQ99732 161 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa15.43■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 INAFM1C9JVW0 142 aa15.43■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA3Q8NHX4 192 aa15.43■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.43■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIAP1O43715 76 aa15.43■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00242Q5T6M2 205 aa15.43■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.43■□□□□ 0.06
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa15.41■□□□□ 0.06
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OVOL2Q9BRP0 275 aa15.41■□□□□ 0.06
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC179H3BU77 68 aa15.4■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBE2L6O14933 153 aa15.39■□□□□ 0.05
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEFB130AP0DP74 79 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DAND5Q8N907 189 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBE2WQ96B02 151 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IFITM1P13164 125 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM243Q9BU79 118 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HERVK_113P63121 156 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FN1P02751 2386 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VWFP04275 2813 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C2orf82Q6UX34 121 aa15.37■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FHL2Q14192 279 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC01600Q96MT4 127 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ICOSQ9Y6W8 199 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A0U1RRA0 63 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MIAQ16674 131 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H7C423 109 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q6Q795 121 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.34■□□□□ 0.05
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPANXCQ9NY87 97 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.33■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NDUFA1O15239 70 aa15.33■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLEC2BQ92478 149 aa15.32■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.32■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.31■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHCHD5Q9BSY4 110 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.28■□□□□ 0.04
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 F5H768 121 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 H3BT86 120 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 X6R8D5 127 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TENM1Q9UKZ4 2725 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEFB4AO15263 64 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRIMA1Q86XR5 153 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TIMM17BO60830 172 aa15.25■□□□□ 0.03
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C9orf66Q5T8R8 295 aa15.25■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LST1O00453 97 aa15.24■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa15.24■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A096LPF7 62 aa15.24■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GYPEP15421 78 aa15.24■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEFB135Q30KP9 77 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM20Q8N5G0 67 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HIVEP1P15822 2718 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00612Q8N6U2 182 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TOMM7Q9P0U1 55 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C5orf38Q86SI9 138 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HERV-K104P63124 156 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COX7B2Q8TF08 81 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRO0255Q9UI72 69 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATRQ13535 2644 aa15.14■□□□□ 0.01
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.14■□□□□ 0.01
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C3orf56Q8N813 242 aa15.14■□□□□ 0.01
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.13■□□□□ 0.01
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa15.13■□□□□ 0.01
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