RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLL5B9A064 214 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 SFTA2Q6UW10 78 aa15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 TAL2Q16559 108 aa15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 ESRGQ1W209 222 aa15.52■□□□□ 0.08
CAPNS1-212ENST00000591041 TENM3Q9P273 2699 aa15.51■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 NUPR2A6NF83 97 aa15.51■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 SPINK8P0C7L1 97 aa15.51■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01556Q5JQF7 62 aa15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.49■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WZ39 114 aa15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 COX6A2Q02221 97 aa15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 C2orf91Q6ZV80 131 aa15.48■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 MIAQ16674 131 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 KLK12Q9UKR0 248 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 COL7A1Q02388 2944 aa15.47■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 COX7A2LO14548 114 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 APOMO95445 188 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-30P01768 117 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-33P01772 117 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 GCSHP23434 173 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 XCL1P47992 114 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 HERV-K104P63124 156 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR34Q9NV39 138 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFA12Q9UI09 145 aa15.46■□□□□ 0.07
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM238C9JI98 176 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 K7EP13 123 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 MALP21145 153 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 BATFQ16520 125 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST1H4GQ99525 98 aa15.45■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 PRSS2P07478 247 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 WFDC10BQ8IUB3 73 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 C10orf126Q8N4M7 172 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 RYR3Q15413 4870 aa15.44■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 A6NDN8 102 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFA1O15239 70 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAH10OSP0CZ25 163 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 COPS9Q8WXC6 57 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 A6NJY4 79 aa15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 COX7B2Q8TF08 81 aa15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2WQ96B02 151 aa15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 UPK3BQ9BT76 320 aa15.42■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZVH6 145 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 RMI2Q96E14 147 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 SNHG12Q9BXW3 62 aa15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 C5orf38Q86SI9 138 aa15.4■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa15.4■□□□□ 0.06
CAPNS1-212ENST00000591041 TIMM17BO60830 172 aa15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 PTTG1IPP53801 180 aa15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 ORAOV1Q8WV07 137 aa15.39■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 CXCL5P42830 114 aa15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 CFAP161Q6P656 301 aa15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00588Q9Y4M8 146 aa15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 C6orf226Q5I0X4 101 aa15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 CEND1Q8N111 149 aa15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 TOMM7Q9P0U1 55 aa15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0J9YXY3 114 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 GAGE12HA6NDE8 117 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8IZM0 81 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf43Q9BWL3 253 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 Q9H8V8 135 aa15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 ENHOQ6UWT2 76 aa15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 TM2D2Q9BX73 214 aa15.35■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 EREGO14944 169 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 CKS1BP61024 79 aa15.34■□□□□ 0.05
CAPNS1-212ENST00000591041 FOXI1Q12951 378 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N3U1 123 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 APLNQ9ULZ1 77 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 COX11Q9Y6N1 276 aa15.32■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 IFITM1P13164 125 aa15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL24P83731 157 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa15.31■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.3■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 SPANXCQ9NY87 97 aa15.3■□□□□ 0.04
CAPNS1-212ENST00000591041 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms