RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561040.1

MEIS3-209, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,809 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-209ENST00000561040 VWFP04275 2813 aa11.53□□□□□ -0.56
MEIS3-209ENST00000561040 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa11.53□□□□□ -0.56
MEIS3-209ENST00000561040 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.53□□□□□ -0.56
MEIS3-209ENST00000561040 Q8NAQ8 132 aa11.53□□□□□ -0.56
MEIS3-209ENST00000561040 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa11.53□□□□□ -0.56
MEIS3-209ENST00000561040 A0A0J9YY99 117 aa11.52□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 DAD1P61803 113 aa11.52□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.52□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 SPART-AS1P0CW21 52 aa11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 GYPEP15421 78 aa11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.51□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.5□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.5□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 PAX4O43316 350 aa11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 ATP5G1P05496 136 aa11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 GAGE6Q13070 117 aa11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.49□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 LINC00242Q5T6M2 205 aa11.48□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.48□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.48□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.48□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.47□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 PSMB2P49721 201 aa11.46□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 KRTAP10-11P60412 298 aa11.46□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa11.46□□□□□ -0.57
MEIS3-209ENST00000561040 DEFB4AO15263 64 aa11.46□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 MT-ATP8P03928 68 aa11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.45□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 XGP55808 180 aa11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 Q6Q795 121 aa11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 A0A0J9YXY3 114 aa11.44□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.43□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 A0A1B0GUV1 79 aa11.43□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 IGHV3-30P01768 117 aa11.43□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa11.43□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 CELA1Q9UNI1 258 aa11.43□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 COX6A2Q02221 97 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 TIMM17BO60830 172 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 LINC01600Q96MT4 127 aa11.42□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 NDUFA1O15239 70 aa11.41□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 F5H768 121 aa11.4□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 CARD19Q96LW7 228 aa11.4□□□□□ -0.58
MEIS3-209ENST00000561040 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.39□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.39□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 SNCGO76070 127 aa11.39□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.39□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 SPANXCQ9NY87 97 aa11.39□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.39□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 GAGE2BQ13066 116 aa11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 GAGE2EQ4V326 116 aa11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.38□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 CFAP161Q6P656 301 aa11.37□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.37□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 TCL1BO95988 128 aa11.37□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 H3BNG1 76 aa11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 HERV-K104P63124 156 aa11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 LITAFQ99732 161 aa11.36□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 IFITM1P13164 125 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 SS18Q15532 418 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 TTC32Q5I0X7 151 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 A0A096LPF7 62 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 SLC25A20O43772 301 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 HTN3P15516 51 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 MIAQ16674 131 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 COPS9Q8WXC6 57 aa11.35□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.34□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.34□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 Q9H8V8 135 aa11.34□□□□□ -0.59
MEIS3-209ENST00000561040 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.33□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 A0A0B4J2C4 111 aa11.33□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 LELP1Q5T871 98 aa11.33□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 A0A087WZ39 114 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 A4D1N5 150 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 CFC1BP0CG36 223 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 CFC1P0CG37 223 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 SFTA2Q6UW10 78 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 LINC01561Q8N1V8 128 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 ATXN8Q156A1 80 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 RETNQ9HD89 108 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.32□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.31□□□□□ -0.6
MEIS3-209ENST00000561040 PRSS2P07478 247 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms