RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 TIMM21Q9BVV7 248 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 GYPEP15421 78 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 RNF213Q63HN8 5207 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE12JA6NER3 117 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE1Q13065 139 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE4Q13068 117 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE5Q13069 117 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE13Q4V321 117 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 SPATA45Q537H7 98 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 TM2D2Q9BX73 214 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087WX48 190 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 TIRAPP58753 221 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 ODF1Q14990 250 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZN92 141 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 BAALCQ8WXS3 180 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 PRSS1P07477 247 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGLC3P0DOY3 106 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 LRP2P98164 4655 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 F8VRH5 84 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 LECT2O14960 151 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 PLNP26678 52 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 PMVKQ15126 192 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01620Q4KN68 170 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 FAM104AQ969W3 186 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 AMELXQ99217 191 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM243Q9BU79 118 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-30P01768 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-33P01772 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 CST9LQ9H4G1 147 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GUV1 79 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GV90 55 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 DPM2O94777 84 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 FGF6P10767 208 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 LELP1Q5T871 98 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 VCX2Q9H322 139 aa6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2L6O14933 153 aa6.09□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGKCP01834 107 aa6.09□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 WFDC2Q14508 124 aa6.09□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.09□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.09□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.08□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 H0Y8G0 127 aa6.08□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.08□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM101Q96IK0 257 aa6.08□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 MT1HL1P0DM35 61 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 SEC11AP67812 179 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZRU5 148 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZUT4 128 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 COX11Q9Y6N1 276 aa6.07□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 C11orf86A6NJI1 115 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 CCL25O15444 150 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2D1P51668 147 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 ATOH7Q8N100 152 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.06□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 155.9 ms