RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547519.1

HECTD4-205, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 3

Gene HECTD4, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-205	ENST00000547519	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	CACNA1H	O95180	2353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HECTD4-205	ENST00000547519	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	FSHB	P01225	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	SLPI	P03973	132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	TFF1	P04155	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	FAM186A	A6NE01	2351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	PI4KA	P42356	2102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	PATE3	B3GLJ2	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	RTL8C	O15255	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	TRANK1	O15050	2925 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519		Q6ZSN1	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519		K7EIM0	57 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519		K7EQD1	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519		M0QY20	66 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519		F5H697	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519		Q8NAQ8	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HECTD4-205	ENST00000547519	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519		M0R2N4	97 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519		A0A1W2PNM2	257 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	NDUFA4	O00483	81 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	ROMO1	P60602	79 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	REG3A	Q06141	175 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.51	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519		H3BPC8	53 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	PRR9	Q5T870	116 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.5	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	CACNA1A	O00555	2505 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	CCL18	P55774	89 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	CCL26	Q9Y258	94 aa		4.49	□□□□□ -1.69
HECTD4-205	ENST00000547519	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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