RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 SS18Q15532 418 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 HIST1H4GQ99525 98 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 A0A0J9YXY3 114 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 GCSHP23434 173 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 B9D2Q9BPU9 175 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 A0A087WZ39 114 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 TAX1BP3O14907 124 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 NDUFA1O15239 70 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 FXYD2P54710 66 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.68□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 TIMM17BO60830 172 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 SMIM13P0DJ93 91 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 PTTG1IPP53801 180 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 REG3AQ06141 175 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 ESRGQ1W209 222 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 A0A1B0GWB2 263 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 TMEM238C9JI98 176 aa6.66□□□□□ -1.34
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CS-209ENST00000547449 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 Q6ZVH6 145 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 PRR34Q9NV39 138 aa6.66□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 HERV-K104P63124 156 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 C5orf38Q86SI9 138 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 Q8N3U1 123 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 COX7B2Q8TF08 81 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 LITAFQ99732 161 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 COX11Q9Y6N1 276 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-209ENST00000547449 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 A6NJY4 79 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 K7EP13 123 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 XCL1P47992 114 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 Q9H8V8 135 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 SPANXCQ9NY87 97 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 C9orf118A6NHY6 69 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 SFTA2Q6UW10 78 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 ENHOQ6UWT2 76 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 KLK12Q9UKR0 248 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 COX7A2LO14548 114 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 IGHV3-33P01772 117 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 IFITM1P13164 125 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 FOXI1Q12951 378 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 MIAQ16674 131 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 Q8IZM0 81 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 CRPP02741 224 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 PRSS2P07478 247 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 CCL18P55774 89 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 RAB37Q96AX2 223 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 UBE2WQ96B02 151 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 A4D1N5 150 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 IGLL5B9A064 214 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 K7ERJ3 54 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 APOMO95445 188 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 CFC1BP0CG36 223 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 CFC1P0CG37 223 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 MALP21145 153 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 KIAA0087Q14695 138 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 COPS9Q8WXC6 57 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-209ENST00000547449 A0A0B4J2C4 111 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-209ENST00000547449 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-209ENST00000547449 H3BUT2 72 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-209ENST00000547449 CXCL5P42830 114 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-209ENST00000547449 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-209ENST00000547449 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-209ENST00000547449 UPK3BQ9BT76 320 aa6.58□□□□□ -1.36
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