RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 CCL24O00175 119 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 DNAL4O96015 105 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 MALP21145 153 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00158P58513 81 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 Q9HAA7 133 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 CR1P17927 2039 aa6.66□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.65□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.65□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.65□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.65□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 C22orf24Q9Y442 160 aa6.65□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 FBN2P35556 2912 aa6.65□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.65□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.65□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 IGKV2D-28P01615 120 aa6.65□□□□□ -1.34
RRN3P1-202ENST00000546471 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP5G1P05496 136 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 CXCL5P42830 114 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.64□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 H0YGX0 51 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 KRTAP10-9P60411 292 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM126AQ9H061 195 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 POLQO75417 2590 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 CCL18P55774 89 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A087WYN8 130 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 AKAP9Q99996 3911 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A087WZ39 114 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 PFN2P35080 140 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 PAX4O43316 350 aa6.61□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 C5orf38Q86SI9 138 aa6.61□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.61□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 CHD6Q8TD26 2715 aa6.61□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 FHL2Q14192 279 aa6.61□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.61□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.61□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 UQCRQO14949 82 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 LECT2O14960 151 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 PRB1P04280 392 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 C3orf56Q8N813 242 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 ACACBO00763 2458 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.59□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.59□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 IGLV1-51P01701 117 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 PIEZO1Q92508 2521 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 CENPEQ02224 2701 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 PLA2G2AP14555 144 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 ESM1Q9NQ30 184 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 ATOX1O00244 68 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 LY6G6DO95868 133 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 SS18Q15532 418 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 XCL1P47992 114 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 DEFB130BP0DP73 79 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 DEFB130AP0DP74 79 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 COX7CP15954 63 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 Q6JHZ5 121 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 Q8IZM0 81 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 CACNA1AO00555 2505 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 NCR3O14931 201 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC01006Q8NI28 216 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 SLPIP03973 132 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 GYPEP15421 78 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00846Q9NV44 126 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 PTPN13Q12923 2485 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.54□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1B0GUV1 79 aa6.54□□□□□ -1.36
RRN3P1-202ENST00000546471 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.3 ms