RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542447.6

CADM1-212, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CADM1, Length 4,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-212ENST00000542447 SCXQ7RTU7 201 aa8.45□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 RNF223E7ERA6 249 aa8.45□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.45□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 SPANXCQ9NY87 97 aa8.45□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 SNURFQ9Y675 71 aa8.45□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 HILS1P60008 231 aa8.44□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 Q6ZSN1 163 aa8.44□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 COX7B2Q8TF08 81 aa8.44□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 CUBNO60494 3623 aa8.44□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 CXCL5P42830 114 aa8.44□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.43□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 NDUFA1O15239 70 aa8.43□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 SERP2Q8N6R1 65 aa8.43□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 BRK1Q8WUW1 75 aa8.43□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.43□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 A0A087WYN8 130 aa8.43□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 PSMB8P28062 276 aa8.42□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 TMEM258P61165 79 aa8.42□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.42□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.42□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.42□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.42□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.42□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 LINC00846Q9NV44 126 aa8.42□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 LMO4P61968 165 aa8.41□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 C9orf85Q96MD7 179 aa8.41□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 ESM1Q9NQ30 184 aa8.41□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 DCANP1Q8TF63 244 aa8.41□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 Q6ZTI0 123 aa8.41□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 IGHG2P01859 326 aa8.4□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.4□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 RELNP78509 3460 aa8.4□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.4□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 MSMBP08118 114 aa8.4□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.4□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 DPH3Q96FX2 82 aa8.4□□□□□ -1.06
CADM1-212ENST00000542447 UPK3BQ9BT76 320 aa8.4□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.39□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 K7EQG2 157 aa8.39□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 USP24Q9UPU5 2620 aa8.39□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 H0YGX0 51 aa8.38□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 CRYGAP11844 174 aa8.38□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.38□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 CHD6Q8TD26 2715 aa8.38□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.38□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.38□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.37□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 GNLYP22749 145 aa8.37□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 A0A1W2PPR1 153 aa8.37□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.37□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 LITAFQ99732 161 aa8.37□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.37□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 FAM236CP0DP71 79 aa8.37□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.36□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.36□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 B4DSR2 109 aa8.35□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 K7EQD1 137 aa8.35□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.35□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 SS18Q15532 418 aa8.35□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.35□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 K7EMT4 169 aa8.34□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 K7ENP7 123 aa8.34□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.34□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.34□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 CCL18P55774 89 aa8.34□□□□□ -1.07
CADM1-212ENST00000542447 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.34□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.34□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 H3BUA1 57 aa8.33□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.33□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 TIMM17BO60830 172 aa8.32□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 A6NDX4 124 aa8.32□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 A8MTW9 85 aa8.32□□□□□ -1.08
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CADM1-212ENST00000542447 ITPR1Q14643 2758 aa8.31□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.31□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 C6orf99Q4VX62 202 aa8.31□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.3□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.3□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 DEFB4AO15263 64 aa8.3□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.3□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 C19orf84I3L1E1 186 aa8.3□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 PLA2G2AP14555 144 aa8.29□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 C2orf48Q96LS8 159 aa8.29□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 F8WEM9 126 aa8.29□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.29□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 Q6JHZ5 121 aa8.29□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.29□□□□□ -1.08
CADM1-212ENST00000542447 AVPP01185 164 aa8.28□□□□□ -1.08
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