RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 A0A096LNJ9 63 aa4.15□□□□□ -1.74
POLK-215ENST00000514141 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.15□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.15□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 hADV29S1A0JD25 119 aa4.14□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 Q6ZQT7 251 aa4.14□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.14□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 Q6JHZ5 121 aa4.14□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.14□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 NDUFB1O75438 58 aa4.13□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 FOXI1Q12951 378 aa4.13□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 X6R8D5 127 aa4.13□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 UBE2BP63146 152 aa4.13□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 A0A0J9YWU9 116 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 C7orf33Q8WU49 177 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 NAV2Q8IVL1 2488 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 UPK3BQ9BT76 320 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.12□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.11□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.11□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 G3V4G9 280 aa4.11□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.11□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 Q8NAQ8 132 aa4.11□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 ETDBQ3ZM63 59 aa4.11□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 DEFB1P60022 68 aa4.1□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 NACAE9PAV3 2078 aa4.1□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 ABCA1O95477 2261 aa4.1□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 NDUFC1O43677 76 aa4.1□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 J3KT08 172 aa4.1□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 LINC00694P0DN24 101 aa4.1□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 UBE2AP49459 152 aa4.09□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.09□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 LINC01600Q96MT4 127 aa4.09□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 A0A0U1RRA0 63 aa4.09□□□□□ -1.75
POLK-215ENST00000514141 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.09□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.09□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.08□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 NBASA2RRP1 2371 aa4.08□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 LECT2O14960 151 aa4.08□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 TCL1BO95988 128 aa4.08□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 PCP4P48539 62 aa4.08□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 PRR34Q9NV39 138 aa4.08□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 A0A096LPF7 62 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 K7ERJ3 54 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 TRIAP1O43715 76 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 NREPQ16612 68 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 IGF2RP11717 2491 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 COL6A3P12111 3177 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 NPC2P61916 151 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 Q9HAA7 133 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.07□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 CACNA1AO00555 2505 aa4.06□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.06□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 C3orf84H3BNL1 204 aa4.06□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 PLXNB1O43157 2135 aa4.06□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 MP68P56378 58 aa4.05□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.05□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.05□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 ATRXP46100 2492 aa4.05□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.05□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 AGRNO00468 2067 aa4.04□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.04□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 CCKP06307 115 aa4.04□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.04□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 Q6ZTC4 211 aa4.04□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 Q8N814 137 aa4.04□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.04□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.04□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.03□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.03□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 NCR3O14931 201 aa4.03□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 C6orf99Q4VX62 202 aa4.03□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 RELNP78509 3460 aa4.03□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.03□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
POLK-215ENST00000514141 EDN2P20800 178 aa4.03□□□□□ -1.76
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