RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 NIT1Q86X76 327 aa4.61□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.61□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.61□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.61□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.6□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 CTRLP40313 264 aa4.6□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.6□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNF185Q96GF1 192 aa4.6□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.6□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.6□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 F2Z2F3 143 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 NUPR1O60356 82 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 APCSP02743 223 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHTF8P0CG12 524 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 ESDP10768 282 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 FABP4P15090 132 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 CACNG7P62955 275 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 HBBP68871 147 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 PYY3Q5JQD4 70 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 GATD1Q8NB37 220 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 TPPP3Q9BW30 176 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 CNFNQ9BYD5 112 aa4.59□□□□□ -1.67
MSC-AS1-202ENST00000512290 hDV102S1A0JD36 115 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 M0QY20 66 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMIM17P0DL12 118 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 CAMPP49913 170 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 SSTP61278 116 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 RIGQ13278 110 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAJINQ3KP22 176 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM18Q96B42 140 aa4.58□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A1B0GUT8 65 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A1B0GW15 77 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 SERF1AO75920 110 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 MGPP08493 103 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 NTF3P20783 257 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 MPV17L2Q567V2 206 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 BAGE3Q86Y29 109 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 NIT2Q9NQR4 276 aa4.57□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 IQCJQ1A5X6 159 aa4.56□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM97Q5BJF2 176 aa4.56□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.56□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 BORCS7Q96B45 105 aa4.56□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.55□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.55□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.55□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 PKIAP61925 76 aa4.55□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 S100A12P80511 92 aa4.55□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 ENHOQ6UWT2 76 aa4.55□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.55□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.55□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.54□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRSS47A8MTI9 375 aa4.54□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 RBX1P62877 108 aa4.54□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 STPG4Q8N801 248 aa4.54□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.54□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.54□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR34Q9NV39 138 aa4.54□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.54□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 PMCHP20382 165 aa4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 AMTP48728 403 aa4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 COX6A2Q02221 97 aa4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 GAGE6Q13070 117 aa4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 MIAQ16674 131 aa4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q6ZRP5 223 aa4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.53□□□□□ -1.68
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A1B0GUV1 79 aa4.52□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.52□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 AMN1Q8IY45 258 aa4.52□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM243Q9BU79 118 aa4.52□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.52□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 HSBP1O75506 76 aa4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 REG3AQ06141 175 aa4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 COTL1Q14019 142 aa4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.51□□□□□ -1.69
MSC-AS1-202ENST00000512290 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms