RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 COX7B2Q8TF08 81 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 XGP55808 180 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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RABGEF1-211ENST00000503687 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.25□□□□□ -0.93
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RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.24□□□□□ -0.93
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RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.23□□□□□ -0.93
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RABGEF1-211ENST00000503687 HERV-K104P63124 156 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-211ENST00000503687 INAFM1C9JVW0 142 aa9.21□□□□□ -0.93
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RABGEF1-211ENST00000503687 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.2□□□□□ -0.94
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RABGEF1-211ENST00000503687 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.19□□□□□ -0.94
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RABGEF1-211ENST00000503687 H3BT86 120 aa9.17□□□□□ -0.94
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RABGEF1-211ENST00000503687 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.17□□□□□ -0.94
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RABGEF1-211ENST00000503687 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
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RABGEF1-211ENST00000503687 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.15□□□□□ -0.94
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RABGEF1-211ENST00000503687 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-211ENST00000503687 CCL18P55774 89 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-211ENST00000503687 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGEF1-211ENST00000503687 IGLV1-51P01701 117 aa9.08□□□□□ -0.96
RABGEF1-211ENST00000503687 H0YGX0 51 aa9.08□□□□□ -0.96
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