RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

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Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 A0A1W2PPR1 153 aa8.69□□□□□ -1.02
PRRX1-207ENST00000497230 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.69□□□□□ -1.02
PRRX1-207ENST00000497230 NDUFA1O15239 70 aa8.69□□□□□ -1.02
PRRX1-207ENST00000497230 LMO4P61968 165 aa8.69□□□□□ -1.02
PRRX1-207ENST00000497230 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PRRX1-207ENST00000497230 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.67□□□□□ -1.02
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PRRX1-207ENST00000497230 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.66□□□□□ -1.02
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PRRX1-207ENST00000497230 ZNF292O60281 2723 aa8.66□□□□□ -1.02
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PRRX1-207ENST00000497230 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.65□□□□□ -1.02
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PRRX1-207ENST00000497230 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.6□□□□□ -1.03
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PRRX1-207ENST00000497230 FAM236CP0DP71 79 aa8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-207ENST00000497230 CRYGAP11844 174 aa8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-207ENST00000497230 A6NDX4 124 aa8.57□□□□□ -1.04
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PRRX1-207ENST00000497230 C19orf84I3L1E1 186 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-207ENST00000497230 K7ENP7 123 aa8.57□□□□□ -1.04
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PRRX1-207ENST00000497230 GNLYP22749 145 aa8.55□□□□□ -1.04
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PRRX1-207ENST00000497230 RMI2Q96E14 147 aa8.53□□□□□ -1.04
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PRRX1-207ENST00000497230 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.53□□□□□ -1.04
PRRX1-207ENST00000497230 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PRRX1-207ENST00000497230 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.52□□□□□ -1.05
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