RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 PLEKHB2Q96CS7 222 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXB3-210ENST00000489475 J3QQQ9 107 aa18.26■□□□□ 0.51
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HOXB3-210ENST00000489475 KLK12Q9UKR0 248 aa18.26■□□□□ 0.51
HOXB3-210ENST00000489475 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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HOXB3-210ENST00000489475 C10orf126Q8N4M7 172 aa18.07■□□□□ 0.48
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HOXB3-210ENST00000489475 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa18.02■□□□□ 0.47
HOXB3-210ENST00000489475 C1orf43Q9BWL3 253 aa18.01■□□□□ 0.47
HOXB3-210ENST00000489475 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa18■□□□□ 0.47
HOXB3-210ENST00000489475 PRSS2P07478 247 aa18■□□□□ 0.47
HOXB3-210ENST00000489475 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
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HOXB3-210ENST00000489475 C6orf226Q5I0X4 101 aa17.99■□□□□ 0.47
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HOXB3-210ENST00000489475 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
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HOXB3-210ENST00000489475 TM2D2Q9BX73 214 aa17.93■□□□□ 0.46
HOXB3-210ENST00000489475 TIMM17BO60830 172 aa17.93■□□□□ 0.46
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HOXB3-210ENST00000489475 CKS1BP61024 79 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXB3-210ENST00000489475 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXB3-210ENST00000489475 RMI2Q96E14 147 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXB3-210ENST00000489475 PTTG1IPP53801 180 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA0087Q14695 138 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXB3-210ENST00000489475 MEIG1Q5JSS6 88 aa17.91■□□□□ 0.46
HOXB3-210ENST00000489475 FXYD2P54710 66 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXB3-210ENST00000489475 TENM2Q9NT68 2774 aa17.9■□□□□ 0.46
HOXB3-210ENST00000489475 CXCL5P42830 114 aa17.89■□□□□ 0.45
HOXB3-210ENST00000489475 SPAG11BQ08648 103 aa17.89■□□□□ 0.45
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