RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GUV1 79 aa7.18□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 TAL2Q16559 108 aa7.18□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZTC4 211 aa7.18□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.18□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.18□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GV90 55 aa7.17□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM262E9PQX1 116 aa7.17□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 SPINK8P0C7L1 97 aa7.17□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.17□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 RBX1P62877 108 aa7.17□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 COX6A2Q02221 97 aa7.17□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 LELP1Q5T871 98 aa7.17□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.17□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.17□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.16□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.16□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.15□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 A6NDN8 102 aa7.15□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 GCSHP23434 173 aa7.15□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 HIST1H4GQ99525 98 aa7.15□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa7.15□□□□□ -1.26
GTPBP1-211ENST00000487538 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.14□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.14□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 CEND1Q8N111 149 aa7.14□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 TM2D2Q9BX73 214 aa7.14□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.13□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.13□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 SS18Q15532 418 aa7.13□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.13□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.13□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.13□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.13□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.12□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 CCL25O15444 150 aa7.12□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 PTTG1IPP53801 180 aa7.12□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 FXYD2P54710 66 aa7.12□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.12□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.12□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.11□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0J9YXY3 114 aa7.11□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM238C9JI98 176 aa7.11□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 TAX1BP3O14907 124 aa7.11□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFA1O15239 70 aa7.11□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.11□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A087WZ39 114 aa7.1□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 REG3AQ06141 175 aa7.1□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.1□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8N3U1 123 aa7.1□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 COX11Q9Y6N1 276 aa7.1□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.09□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 A6NJY4 79 aa7.09□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 K7EP13 123 aa7.09□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 TIMM17BO60830 172 aa7.09□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM13P0DJ93 91 aa7.09□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 XCL1P47992 114 aa7.09□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.09□□□□□ -1.27
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-30P01768 117 aa7.08□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.08□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 Q6ZVH6 145 aa7.08□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 C5orf38Q86SI9 138 aa7.08□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.08□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.08□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 COX7B2Q8TF08 81 aa7.08□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 Q9H8V8 135 aa7.08□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 K7ERJ3 54 aa7.07□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 HERV-K104P63124 156 aa7.07□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 ESRGQ1W209 222 aa7.07□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.07□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.07□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 LITAFQ99732 161 aa7.07□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR34Q9NV39 138 aa7.07□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GWB2 263 aa7.06□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf118A6NHY6 69 aa7.06□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV3-33P01772 117 aa7.06□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 RAB37Q96AX2 223 aa7.06□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.06□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 SPANXCQ9NY87 97 aa7.06□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 KLK12Q9UKR0 248 aa7.06□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.05□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 COX7A2LO14548 114 aa7.05□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 CRPP02741 224 aa7.05□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 MIAQ16674 131 aa7.05□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 SFTA2Q6UW10 78 aa7.05□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.05□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.04□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.04□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.03□□□□□ -1.28
GTPBP1-211ENST00000487538 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.03□□□□□ -1.28
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