RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 PET117Q6UWS5 81 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 F8VRH5 84 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 NUPR1O60356 82 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-210ENST00000486889 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 C5orf52A6NGY3 159 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 DPM2O94777 84 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00310P59036 64 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 A0A0J9YXV3 536 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 F8WDY8 70 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 IGLC3P0DOY3 106 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 SFTA2Q6UW10 78 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 A0A087WZ39 114 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 hDV102S1A0JD36 115 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 IGKCP01834 107 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 FOXI1Q12951 378 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 C5orf38Q86SI9 138 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.5□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 RYR2Q92736 4967 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 LCE2BO14633 110 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 CKS1BP61024 79 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf86A6NJI1 115 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 USP17L23D6RBM5 183 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 SCGB1D1O95968 90 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 C3orf79P0CE67 100 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 CXCL5P42830 114 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 ODF1Q14990 250 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 FAM104AQ969W3 186 aa6.48□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 A0A087WTM6 91 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 SPAG11BQ08648 103 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01545Q5VT33 79 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.47□□□□□ -1.37
CTPS1-210ENST00000486889 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00587B1AMM8 73 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFA1O15239 70 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 Q8IZM0 81 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 Q8N814 137 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 C2orf48Q96LS8 159 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.46□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 LECT2O14960 151 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 RTL8CO15255 209 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 COX6A2Q02221 97 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 COX7B2Q8TF08 81 aa6.45□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 SPINK8P0C7L1 97 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 GCSHP23434 173 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.44□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM223A0PJW6 202 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 NMUP48645 174 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 SYCNQ0VAF6 134 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 CARD19Q96LW7 228 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.43□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 LEPROTO15243 131 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 HERV-K104P63124 156 aa6.42□□□□□ -1.38
CTPS1-210ENST00000486889 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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