RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 Q8N3U1 123 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 LINC00574Q9H8X3 128 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 UBE2D3P61077 147 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 UBE2D2P62837 147 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 TSHBP01222 138 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 CD164L2Q6UWJ8 174 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 NCKAP5O14513 1909 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 MUC7Q8TAX7 377 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 LINC00310P59036 64 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 LY6LH3BQJ8 138 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 IGLV2-11P01706 119 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 IGHV4-31P0DP07 118 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC168Q8NDH2 2452 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 IGKV2D-28P01615 120 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 PRORYQ9H606 182 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 A6NDX4 124 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRN-211ENST00000462351 VPREB1P12018 145 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 COX17Q14061 63 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 COL4A2P08572 1712 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 RPL28P46779 137 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 ESRGQ1W209 222 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 CRYGDP07320 174 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 EXPH5Q8NEV8 1989 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 PROK1P58294 105 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 MUC4Q99102 2169 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 F8P00451 2351 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 IGIPA6NJ69 53 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 C19orf84I3L1E1 186 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 CNFNQ9BYD5 112 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 ODF3BA8MYP8 253 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 LINC01548A6NM66 108 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 Q8N814 137 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 LMO4P61968 165 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 DEFB114Q30KQ6 69 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 Q8IZM0 81 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 GAS8-AS1O95177 125 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 ABCA2Q9BZC7 2435 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.59□□□□□ -0.71
PTPRN-211ENST00000462351 C11orf21Q9P2W6 132 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 FSTL3O95633 263 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 Q6ZVQ6 151 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 LIMD2Q9BT23 127 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 C1orf137Q5JT78 98 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 CHD7Q9P2D1 2997 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 CDIP1Q9H305 208 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa10.57□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 Q8N6K4 173 aa10.56□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 KLLNB2CW77 178 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 BRCA2P51587 3418 aa10.55□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 hDV103S1A0JD37 113 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 CRYGAP11844 174 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 LINC00846Q9NV44 126 aa10.54□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 PCOTHQ58A44 107 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
PTPRN-211ENST00000462351 A0A087WYN8 130 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 PRR9Q5T870 116 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 Q6ZSV7 163 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 C5orf42Q9H799 3197 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 SMIM1B2RUZ4 78 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 LINC00575Q6W349 94 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 IL17DQ8TAD2 202 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 NAV2Q8IVL1 2488 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 H0Y9P7 68 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRN-211ENST00000462351 LELP1Q5T871 98 aa10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms