RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.64□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.64□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.64□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 PTPRSQ13332 1948 aa8.64□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 INAFM1C9JVW0 142 aa8.64□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.64□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.64□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.64□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZTI0 123 aa8.64□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 X6R8D5 127 aa8.63□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 NACAE9PAV3 2078 aa8.63□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.63□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 UTRNP46939 3433 aa8.63□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.62□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.62□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 ODF3BA8MYP8 253 aa8.62□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.62□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 C19orf84I3L1E1 186 aa8.62□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 GAS8-AS1O95177 125 aa8.61□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 REG3GQ6UW15 175 aa8.61□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.61□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 J3QL48 77 aa8.6□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 HILS1P60008 231 aa8.6□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 PRO0255Q9UI72 69 aa8.6□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.6□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.6□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.6□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 LY6LH3BQJ8 138 aa8.6□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.6□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 Q8NA96 180 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 CACNA1AO00555 2505 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0J9YX75 114 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 A8MUN3 132 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.59□□□□□ -1.03
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1B0GW54 56 aa8.58□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 PROK1P58294 105 aa8.58□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.58□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 K7EMT4 169 aa8.58□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 BPY2O14599 106 aa8.57□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.57□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.57□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.57□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.57□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV2D-28P01615 120 aa8.57□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.57□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.56□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.56□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 C3orf84H3BNL1 204 aa8.56□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 MIAQ16674 131 aa8.56□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.56□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 ATRXP46100 2492 aa8.55□□□□□ -1.04
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CCBE1-202ENST00000439986 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.55□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.54□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 UBE2D1P51668 147 aa8.54□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 CDSNQ15517 529 aa8.54□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 A0A096LNJ9 63 aa8.54□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 TNP2Q05952 138 aa8.54□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 CNFNQ9BYD5 112 aa8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 LY6G6CO95867 125 aa8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 FSTL3O95633 263 aa8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 CCKP06307 115 aa8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 C14orf177Q52M58 125 aa8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZRU5 148 aa8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.52□□□□□ -1.04
CCBE1-202ENST00000439986 PRR9Q5T870 116 aa8.52□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 CDIP1Q9H305 208 aa8.52□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 LMO4P61968 165 aa8.52□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 UBE2D2P62837 147 aa8.52□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 PTPN13Q12923 2485 aa8.51□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 BCE1O60756 84 aa8.51□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 LUZP6Q538Z0 58 aa8.51□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.51□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 Q6YL49 198 aa8.51□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.5□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 SORL1Q92673 2214 aa8.5□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 Q8N9L7 120 aa8.5□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 M0QY20 66 aa8.49□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZS46 218 aa8.49□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.49□□□□□ -1.05
CCBE1-202ENST00000439986 BRI3O95415 125 aa8.49□□□□□ -1.05
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