RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0B4J2C4 111 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0J9YXV3 536 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 TIMM17BO60830 172 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 TIRAPP58753 221 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZUT4 128 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM243Q9BU79 118 aa4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 APOMO95445 188 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-30P01768 117 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 IFITM1P13164 125 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2D3P61077 147 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 UBE2D2P62837 147 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF151Q2KHN1 245 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE13Q4V321 117 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 SFTA2Q6UW10 78 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZTI0 123 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 OVOL2Q9BRP0 275 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPANXCQ9NY87 97 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0J9YXY3 114 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 APOC4P55056 127 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 HERV-K104P63124 156 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q1RN00 199 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.49□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE12JA6NER3 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 NDUFA1O15239 70 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE7O76087 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 TSPAN13O95857 204 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 COX6CP09669 75 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE12FP0CL80 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE12GP0CL81 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE12IP0CL82 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSMB2P49721 201 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE4Q13068 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 GAGE5Q13069 117 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIAQ16674 131 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q6ZSN1 163 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF183Q96D59 192 aa4.48□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPINK8P0C7L1 97 aa4.47□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.47□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBX1P62877 108 aa4.47□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 ERG28Q9UKR5 140 aa4.47□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 A4D1N5 150 aa4.46□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYRM9A8MSI8 78 aa4.46□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 H3BMG7 143 aa4.46□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRM2P04554 102 aa4.46□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.46□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.46□□□□□ -1.69
SHQ1P1-201ENST00000437111 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRSS2P07478 247 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFC1BP0CG36 223 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 CFC1P0CG37 223 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATXN8Q156A1 80 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.46□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.45□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.45□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.45□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0QXV9 152 aa4.45□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.45□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.45□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.45□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.45□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.44□□□□□ -1.7
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms