RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TNS3-204ENST00000428457 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.34□□□□□ -1.23
TNS3-204ENST00000428457 B9D2Q9BPU9 175 aa7.34□□□□□ -1.23
TNS3-204ENST00000428457 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.34□□□□□ -1.23
TNS3-204ENST00000428457 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.34□□□□□ -1.23
TNS3-204ENST00000428457 PRR4Q16378 134 aa7.34□□□□□ -1.23
TNS3-204ENST00000428457 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TNS3-204ENST00000428457 ZNF580Q9UK33 172 aa7.34□□□□□ -1.23
TNS3-204ENST00000428457 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.34□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 KRTAP10-9P60411 292 aa7.33□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.33□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 PCNTO95613 3336 aa7.33□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.33□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 Q8N6K4 173 aa7.33□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 NDUFB1O75438 58 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 C3orf84H3BNL1 204 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.32□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 AGRNO00468 2067 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 LY6G6CO95867 125 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 REG3AQ06141 175 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 H0Y9J4 135 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 IGLV1-40P01703 118 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 Q6ZQY7 126 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 CCKP06307 115 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 C1orf195Q5TG92 126 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 Q6JHZ5 121 aa7.31□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.3□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 KLLNB2CW77 178 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 CDSNQ15517 529 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 SMR3AQ99954 134 aa7.29□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.28□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.28□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.28□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 C9orf85Q96MD7 179 aa7.28□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TNS3-204ENST00000428457 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 A0A096LNI7 61 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 NDUFC1O43677 76 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.27□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 A0A087WYN8 130 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 EDN2P20800 178 aa7.26□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 A0A0J9YWU9 116 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 IGKV4-1P06312 121 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 BRI3O95415 125 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.25□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 CELA1Q9UNI1 258 aa7.24□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.24□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.24□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.24□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 AVPP01185 164 aa7.23□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 COX6A2Q02221 97 aa7.23□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 LELP1Q5T871 98 aa7.23□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.23□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.23□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.23□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 IGKV2D-28P01615 120 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 IGLV1-51P01701 117 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 PRO0461Q9UI25 63 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 A6NED7 52 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.22□□□□□ -1.25
TNS3-204ENST00000428457 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.21□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 A0A087WZ39 114 aa7.2□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.2□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 LINC00846Q9NV44 126 aa7.2□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms