RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412315.5

NRXN1-212, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-212ENST00000412315 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 TMEM262E9PQX1 116 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 RBX1P62877 108 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 HERV-K104P63124 156 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 COX6A2Q02221 97 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 SS18Q15532 418 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 SFTA2Q6UW10 78 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 ATRQ13535 2644 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 A0A1W2PPM0 123 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 HTN3P15516 51 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 COPS9Q8WXC6 57 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 K7ERJ3 54 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 IGHV3-30P01768 117 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 FABP2P12104 132 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 RETNQ9HD89 108 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 SPANXCQ9NY87 97 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.68□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.68□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 A0A096LPF7 62 aa6.68□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.68□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 IFITM1P13164 125 aa6.68□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 A0A087WZ39 114 aa6.67□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 K7EP34 96 aa6.67□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 MIAQ16674 131 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 A0A0J9YWU9 116 aa6.65□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 IGLL5B9A064 214 aa6.65□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.65□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 COX7B2Q8TF08 81 aa6.65□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 LITAFQ99732 161 aa6.65□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 Q9H8V8 135 aa6.65□□□□□ -1.34
NRXN1-212ENST00000412315 A0A0B4J2C4 111 aa6.65□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 K7EIL1 84 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 Q6ZTC4 211 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 VWFP04275 2813 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.63□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 REG3AQ06141 175 aa6.63□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.63□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 A4D1N5 150 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 COX7A2LO14548 114 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 PRSS2P07478 247 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 CXCL5P42830 114 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.62□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 APOMO95445 188 aa6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 CFC1BP0CG36 223 aa6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 CFC1P0CG37 223 aa6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 XCL1P47992 114 aa6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 Q8IZM0 81 aa6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 PRR34Q9NV39 138 aa6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 C5orf38Q86SI9 138 aa6.61□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.6□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.6□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 CRPP02741 224 aa6.6□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 MDFIQ99750 246 aa6.6□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.6□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 ERG28Q9UKR5 140 aa6.6□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 TSPAN13O95857 204 aa6.59□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 MALP21145 153 aa6.59□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.59□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.59□□□□□ -1.35
NRXN1-212ENST00000412315 F8W1H4 67 aa6.58□□□□□ -1.36
NRXN1-212ENST00000412315 H3BMG7 143 aa6.58□□□□□ -1.36
NRXN1-212ENST00000412315 K7ERU9 68 aa6.58□□□□□ -1.36
NRXN1-212ENST00000412315 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.58□□□□□ -1.36
NRXN1-212ENST00000412315 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.58□□□□□ -1.36
NRXN1-212ENST00000412315 IGHV3-33P01772 117 aa6.58□□□□□ -1.36
NRXN1-212ENST00000412315 CFAP161Q6P656 301 aa6.58□□□□□ -1.36
NRXN1-212ENST00000412315 FOXI1Q12951 378 aa6.57□□□□□ -1.36
NRXN1-212ENST00000412315 MUC7Q8TAX7 377 aa6.57□□□□□ -1.36
NRXN1-212ENST00000412315 KLK12Q9UKR0 248 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms