RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336425.9

TBXAS1-201, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TBXAS1, Length 2,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-201ENST00000336425 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 CRLF1O75462 422 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 C16orf95Q9H693 158 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 GAGE7O76087 117 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 IGLV1-51P01701 117 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 GAGE12FP0CL80 117 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 GAGE12GP0CL81 117 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 GAGE12IP0CL82 117 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 LINC01006Q8NI28 216 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 WFDC10AQ9H1F0 79 aa11.17□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 TENM4Q6N022 2769 aa11.16□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.16□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 Q6Q795 121 aa11.16□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.16□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.16□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 GAGE2BQ13066 116 aa11.15□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 GAGE2EQ4V326 116 aa11.15□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.15□□□□□ -0.62
TBXAS1-201ENST00000336425 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 KRTAP1-1Q07627 177 aa11.14□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.14□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.14□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.14□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 COX7B2Q8TF08 81 aa11.13□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 NF1P21359 2839 aa11.12□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 TRACP01848 142 aa11.12□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 PLA2G2AP14555 144 aa11.12□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.11□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 FHL2Q14192 279 aa11.11□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.11□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 PF4P02776 101 aa11.11□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 GAGE6Q13070 117 aa11.11□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa11.1□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.1□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 JMJD1CQ15652 2540 aa11.09□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.09□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.09□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.09□□□□□ -0.63
TBXAS1-201ENST00000336425 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.08□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 CUBNO60494 3623 aa11.08□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.08□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa11.08□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 J3QKU1 62 aa11.07□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 TTC32Q5I0X7 151 aa11.07□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 FAM218AQ96MZ4 157 aa11.07□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.06□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 A0A087WZ39 114 aa11.06□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 IGKV2D-28P01615 120 aa11.06□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 CRPP02741 224 aa11.06□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.06□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 C22orf24Q9Y442 160 aa11.06□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 ACYP1P07311 99 aa11.06□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.06□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.05□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.05□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 TOMM7Q9P0U1 55 aa11.05□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.05□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.04□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.04□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.04□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.04□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.04□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 BAALC-AS2P0C853 105 aa11.04□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
TBXAS1-201ENST00000336425 CCL18P55774 89 aa11.02□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.01□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 LINC00158P58513 81 aa11.01□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 HILS1P60008 231 aa11.01□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 PDZD2O15018 2839 aa11.01□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 SDIM1Q6ZPB5 146 aa11□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 C5orf38Q86SI9 138 aa11□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 SMIM11BQ8TCY0 68 aa11□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 DEFB130BP0DP73 79 aa10.99□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 DEFB130AP0DP74 79 aa10.99□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 A0A1B0GUV1 79 aa10.98□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 SMCR5Q8TEV8 140 aa10.98□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 GYPEP15421 78 aa10.97□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 MALP21145 153 aa10.97□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 Q9HAA7 133 aa10.97□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 INAFM2P0DMQ5 153 aa10.97□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 IMUPQ9GZP8 106 aa10.97□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 H0YGX0 51 aa10.96□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 X6R8D5 127 aa10.96□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 ACANP16112 2415 aa10.96□□□□□ -0.65
TBXAS1-201ENST00000336425 A0A087WYN8 130 aa10.96□□□□□ -0.66
TBXAS1-201ENST00000336425 PFN2P35080 140 aa10.96□□□□□ -0.66
TBXAS1-201ENST00000336425 KRTAP10-3P60369 221 aa10.96□□□□□ -0.66
TBXAS1-201ENST00000336425 LINC00643Q86TS7 51 aa10.96□□□□□ -0.66
TBXAS1-201ENST00000336425 LINC00482Q8N8I6 264 aa10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms