RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 VAMP3Q15836 100 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 MAST4O15021 2626 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0J9YWU9 116 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1B0GWB2 263 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 A6NJY4 79 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 TMEM238C9JI98 176 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 H3BUT2 72 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 NDUFA1O15239 70 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 K7EIL1 84 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 Q6ZTC4 211 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 MDFIQ99750 246 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 LELP1Q5T871 98 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 LITAFQ99732 161 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 UBE2V1Q13404 147 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 SPATA25Q9BR10 227 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 H3BNG1 76 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 Q8N3U1 123 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 Q9H8V8 135 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 SS18Q15532 418 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PPM0 123 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 IGLL5B9A064 214 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 CCL25O15444 150 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 TIMM17BO60830 172 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 SPANXCQ9NY87 97 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 COL6A5A8TX70 2615 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 A0A087WZ39 114 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 APOMO95445 188 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 C5orf38Q86SI9 138 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 COX7B2Q8TF08 81 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 A4D1N5 150 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 XCL1P47992 114 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 MIAQ16674 131 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 MRAPQ8TCY5 172 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF548-201ENST00000336128 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.52□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 ANK2Q01484 3957 aa8.52□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 K7EP34 96 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 CFC1BP0CG36 223 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 CFC1P0CG37 223 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 FABP2P12104 132 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 REG3AQ06141 175 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 HERV-K104P63124 156 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 GAGE10A6NGK3 116 aa8.5□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 PRSS2P07478 247 aa8.5□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.5□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 NPC2P61916 151 aa8.5□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.5□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.49□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.49□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 DAND5Q8N907 189 aa8.49□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0B4J2C4 111 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 TSPAN13O95857 204 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 IFITM1P13164 125 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 IGHV3-33P01772 117 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0U1RRA0 63 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 KLK12Q9UKR0 248 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 COX7A2LO14548 114 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 ESRGQ1W209 222 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 PRR34Q9NV39 138 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF548-201ENST00000336128 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.46□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 FOXI1Q12951 378 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 ENHOQ6UWT2 76 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 Q8IZM0 81 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 TENM3Q9P273 2699 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 SFTA2Q6UW10 78 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF548-201ENST00000336128 NOTCH1P46531 2555 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms