RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE2DQ9UEU5 116 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 CRLF1O75462 422 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD1-201ENST00000331462 ANAPC13Q9BS18 74 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 C19orf73Q9NVV2 129 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 AKAP9Q99996 3911 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 C16orf95Q9H693 158 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0U1RRA0 63 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 IGLV1-51P01701 117 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 TRACP01848 142 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 TRGV2A0A075B6R0 118 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE7O76087 117 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE12FP0CL80 117 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE12GP0CL81 117 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE12IP0CL82 117 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 PF4P02776 101 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 LINC01006Q8NI28 216 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 TENM4Q6N022 2769 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXD1-201ENST00000331462 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 COX7B2Q8TF08 81 aa15.89■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 WFDC10AQ9H1F0 79 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 ITPR3Q14573 2671 aa15.88■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa15.87■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 APCP25054 2843 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 ACYP1P07311 99 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 TLN2Q9Y4G6 2542 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 FHL2Q14192 279 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 RPL28P46779 137 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa15.85■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 KRTAP1-1Q07627 177 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE6Q13070 117 aa15.84■□□□□ 0.13
HOXD1-201ENST00000331462 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 TTC32Q5I0X7 151 aa15.83■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 CRPP02741 224 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.82■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 A0A087WZ39 114 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 SONP18583 2426 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 FAM218AQ96MZ4 157 aa15.8■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV2D-28P01615 120 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00337Q8N6G1 96 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 C22orf24Q9Y442 160 aa15.79■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00612Q8N6U2 182 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 BAALC-AS2P0C853 105 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 CHCHD5Q9BSY4 110 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXD1-201ENST00000331462 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 TOMM7Q9P0U1 55 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 NOTCH3Q9UM47 2321 aa15.76■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 SDIM1Q6ZPB5 146 aa15.75■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 CCL18P55774 89 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00158P58513 81 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 IMUPQ9GZP8 106 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 NF1P21359 2839 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 JMJD1CQ15652 2540 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 INAFM2P0DMQ5 153 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM11BQ8TCY0 68 aa15.71■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 MALP21145 153 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 HILS1P60008 231 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00643Q86TS7 51 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1B0GUV1 79 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 H0YGX0 51 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 C5orf38Q86SI9 138 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 LINC01561Q8N1V8 128 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 SMCR5Q8TEV8 140 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC179H3BU77 68 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 Q9HAA7 133 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 LY6G6DO95868 133 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB130BP0DP73 79 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB130AP0DP74 79 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 GYPEP15421 78 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 B5MCH6 92 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 Q8IZM0 81 aa15.65■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.65■□□□□ 0.1
HOXD1-201ENST00000331462 A0A087WYN8 130 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD1-201ENST00000331462 DNAL4O96015 105 aa15.64■□□□□ 0.09
HOXD1-201ENST00000331462 SS18Q15532 418 aa15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms