RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.69□□□□□ -0.54
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SHQ1-201ENST00000325599 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa11.69□□□□□ -0.54
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SHQ1-201ENST00000325599 DPH3Q96FX2 82 aa11.51□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.5□□□□□ -0.57
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SHQ1-201ENST00000325599 NOTCH2Q04721 2471 aa11.5□□□□□ -0.57
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SHQ1-201ENST00000325599 J3QKU1 62 aa11.5□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 IMUPQ9GZP8 106 aa11.5□□□□□ -0.57
SHQ1-201ENST00000325599 COX6CP09669 75 aa11.49□□□□□ -0.57
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