RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00242Q5T6M2 205 aa10.66□□□□□ -0.7
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBMY1CP0DJD4 496 aa10.65□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF415Q09FC8 603 aa10.65□□□□□ -0.7
CCNDBP1-201ENST00000300213 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C5orf38Q86SI9 138 aa10.64□□□□□ -0.71
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CCNDBP1-201ENST00000300213 ENHOQ6UWT2 76 aa10.64□□□□□ -0.71
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa10.59□□□□□ -0.71
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.59□□□□□ -0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.59□□□□□ -0.71
CCNDBP1-201ENST00000300213 C6orf226Q5I0X4 101 aa10.59□□□□□ -0.71
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CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 FHL2Q14192 279 aa10.57□□□□□ -0.72
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CCNDBP1-201ENST00000300213 COX7B2Q8TF08 81 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.56□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0U1RQV1 116 aa10.55□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC01600Q96MT4 127 aa10.55□□□□□ -0.72
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CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1W2PRX2 142 aa10.53□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q96MF0 132 aa10.53□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 CHD6Q8TD26 2715 aa10.53□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6JHZ5 121 aa10.53□□□□□ -0.72
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CCNDBP1-201ENST00000300213 BEAN1Q3B7T3 259 aa10.53□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.53□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 C22orf24Q9Y442 160 aa10.53□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa10.52□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM222AQ5U5X8 452 aa10.52□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 OVOL2Q9BRP0 275 aa10.52□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.52□□□□□ -0.72
CCNDBP1-201ENST00000300213 H0YGX0 51 aa10.52□□□□□ -0.73
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CCNDBP1-201ENST00000300213 UPK3BQ9BT76 320 aa10.52□□□□□ -0.73
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CCNDBP1-201ENST00000300213 NBL1P41271 181 aa10.52□□□□□ -0.73
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CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM236CP0DP71 79 aa10.51□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSMB8P28062 276 aa10.51□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa10.51□□□□□ -0.73
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CCNDBP1-201ENST00000300213 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.5□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM86BQ8N661 226 aa10.49□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGLV1-40P01703 118 aa10.49□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 BRK1Q8WUW1 75 aa10.48□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa10.48□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 S100A7L2Q5SY68 101 aa10.48□□□□□ -0.73
CCNDBP1-201ENST00000300213 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.48□□□□□ -0.73
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CCNDBP1-201ENST00000300213 C19orf84I3L1E1 186 aa10.47□□□□□ -0.73
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