RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 ITPR2Q14571 2701 aa19.88■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 PLAC8L1A1L4L8 177 aa19.87■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 MEIG1Q5JSS6 88 aa19.87■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 C16orf95Q9H693 158 aa19.87■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa19.86■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 SNCGO76070 127 aa19.86■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 DEFB121Q5J5C9 76 aa19.85■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa19.85■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 TRGV2A0A075B6R0 118 aa19.84■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 OVOL2Q9BRP0 275 aa19.84■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 COX7A2LO14548 114 aa19.83■□□□□ 0.77
UBP1-201ENST00000283628 SHISA2Q6UWI4 295 aa19.83■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 A0A0U1RRA0 63 aa19.82■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 GAGE7O76087 117 aa19.82■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 GAGE12FP0CL80 117 aa19.82■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 GAGE12GP0CL81 117 aa19.82■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 GAGE12IP0CL82 117 aa19.82■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 IGLV1-51P01701 117 aa19.82■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 LINC01006Q8NI28 216 aa19.82■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa19.81■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 C19orf73Q9NVV2 129 aa19.8■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 WNK1Q9H4A3 2382 aa19.8■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa19.79■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 HILS1P60008 231 aa19.79■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 GAGE2BQ13066 116 aa19.79■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 GAGE2EQ4V326 116 aa19.79■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 GAGE2DQ9UEU5 116 aa19.79■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 Q6Q795 121 aa19.78■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 ACANP16112 2415 aa19.78■□□□□ 0.76
UBP1-201ENST00000283628 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa19.77■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 WFDC10AQ9H1F0 79 aa19.77■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa19.76■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 SMR3AQ99954 134 aa19.75■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 ANAPC13Q9BS18 74 aa19.75■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 CRLF1O75462 422 aa19.74■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 COX7B2Q8TF08 81 aa19.74■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 PF4P02776 101 aa19.74■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 C15orf53Q8NAA6 179 aa19.74■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 TRACP01848 142 aa19.72■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa19.72■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa19.71■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 FAM222AQ5U5X8 452 aa19.71■□□□□ 0.75
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UBP1-201ENST00000283628 FHL2Q14192 279 aa19.71■□□□□ 0.75
UBP1-201ENST00000283628 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa19.7■□□□□ 0.74
UBP1-201ENST00000283628 LY6G6DO95868 133 aa19.69■□□□□ 0.74
UBP1-201ENST00000283628 NF1P21359 2839 aa19.68■□□□□ 0.74
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UBP1-201ENST00000283628 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa19.65■□□□□ 0.74
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa19.65■□□□□ 0.74
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UBP1-201ENST00000283628 CHCHD5Q9BSY4 110 aa19.65■□□□□ 0.74
UBP1-201ENST00000283628 CRPP02741 224 aa19.64■□□□□ 0.74
UBP1-201ENST00000283628 RPL28P46779 137 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.74
UBP1-201ENST00000283628 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa19.64■□□□□ 0.74
UBP1-201ENST00000283628 TTC32Q5I0X7 151 aa19.64■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 TOMM7Q9P0U1 55 aa19.63■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 A0A087WZ39 114 aa19.62■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa19.61■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 HECTD1Q9ULT8 2610 aa19.61■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa19.61■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 MTORP42345 2549 aa19.6■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa19.6■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 NOTCH3Q9UM47 2321 aa19.6■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa19.6■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 BAALC-AS2P0C853 105 aa19.59■□□□□ 0.73
UBP1-201ENST00000283628 LINC00158P58513 81 aa19.58■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 LINC00337Q8N6G1 96 aa19.58■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 FAM218AQ96MZ4 157 aa19.58■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa19.57■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2D-28P01615 120 aa19.57■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 LINC00612Q8N6U2 182 aa19.57■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 HIVEP2P31629 2446 aa19.56■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 JMJD1CQ15652 2540 aa19.56■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa19.54■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa19.54■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 C2CD3Q4AC94 2353 aa19.53■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP19.53■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 CCL18P55774 89 aa19.53■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 DEFB130BP0DP73 79 aa19.52■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 DEFB130AP0DP74 79 aa19.52■□□□□ 0.72
UBP1-201ENST00000283628 C5orf38Q86SI9 138 aa19.51■□□□□ 0.71
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP10-3P60369 221 aa19.5■□□□□ 0.71
UBP1-201ENST00000283628 C22orf24Q9Y442 160 aa19.5■□□□□ 0.71
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GUV1 79 aa19.5■□□□□ 0.71
UBP1-201ENST00000283628 INAFM2P0DMQ5 153 aa19.5■□□□□ 0.71
UBP1-201ENST00000283628 INAFM1C9JVW0 142 aa19.49■□□□□ 0.71
UBP1-201ENST00000283628 H0YGX0 51 aa19.48■□□□□ 0.71
UBP1-201ENST00000283628 GYPEP15421 78 aa19.48■□□□□ 0.71
UBP1-201ENST00000283628 SMIM11BQ8TCY0 68 aa19.48■□□□□ 0.71
UBP1-201ENST00000283628 OTOGQ6ZRI0 2925 aa19.48■□□□□ 0.71
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