RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 SERP2Q8N6R1 65 aa4.72□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 COX7CP15954 63 aa4.72□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 CNFNQ9BYD5 112 aa4.72□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM89A2RUT3 159 aa4.71□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 VPREB1P12018 145 aa4.71□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 C6orf99Q4VX62 202 aa4.71□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 K7EQG2 157 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2AP49459 152 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 LY6LH3BQJ8 138 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 DCANP1Q8TF63 244 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.71□□□□□ -1.66
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SBNO1-201ENST00000267176 Q8NA96 180 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CCKP06307 115 aa4.71□□□□□ -1.66
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SBNO1-201ENST00000267176 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 USP34Q70CQ2 3546 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 A6NDX4 124 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV4-1P06312 121 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 LMO4P61968 165 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 USP17L23D6RBM5 183 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TIMM17BO60830 172 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TSHBP01222 138 aa4.69□□□□□ -1.66
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SBNO1-201ENST00000267176 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 F8W735 103 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 PRR9Q5T870 116 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 PIEZO1Q92508 2521 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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SBNO1-201ENST00000267176 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 NOTCH2Q04721 2471 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 A0A096LNI7 61 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.68□□□□□ -1.66
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SBNO1-201ENST00000267176 SPEGQ15772 3267 aa4.67□□□□□ -1.66
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SBNO1-201ENST00000267176 COX17Q14061 63 aa4.64□□□□□ -1.67
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SBNO1-201ENST00000267176 A6NED7 52 aa4.64□□□□□ -1.67
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SBNO1-201ENST00000267176 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF580Q9UK33 172 aa4.64□□□□□ -1.67
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SBNO1-201ENST00000267176 B9D2Q9BPU9 175 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 C19orf84I3L1E1 186 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 C4orf26Q17RF5 130 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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