RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 SERP2Q8N6R1 65 aa4.72□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 COX7CP15954 63 aa4.72□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 CNFNQ9BYD5 112 aa4.72□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM89A2RUT3 159 aa4.71□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 VPREB1P12018 145 aa4.71□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 C6orf99Q4VX62 202 aa4.71□□□□□ -1.65
SBNO1-201ENST00000267176 K7EQG2 157 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2AP49459 152 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 LY6LH3BQJ8 138 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 DCANP1Q8TF63 244 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 C3orf84H3BNL1 204 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 Q8NA96 180 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CCKP06307 115 aa4.71□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 USP34Q70CQ2 3546 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 A6NDX4 124 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV4-1P06312 121 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 LMO4P61968 165 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 USP17L23D6RBM5 183 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TIMM17BO60830 172 aa4.7□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TSHBP01222 138 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 F8W735 103 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 PRR9Q5T870 116 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 PIEZO1Q92508 2521 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 PRORYQ9H606 182 aa4.69□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 PRM2P04554 102 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 NOTCH2Q04721 2471 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 A0A096LNI7 61 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV2D-28P01615 120 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.68□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 IGIPA6NJ69 53 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2D1P51668 147 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 KLLNB2CW77 178 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2D3P61077 147 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 UBE2D2P62837 147 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 EBI3Q14213 229 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 SPEGQ15772 3267 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 FSTL3O95633 263 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 Q6ZSV7 163 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CRYGDP07320 174 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 Q6ZQY7 126 aa4.67□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 WIPF1O43516 503 aa4.66□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.66□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 CENPEQ02224 2701 aa4.66□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.66□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 A0A0J9YWU9 116 aa4.66□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 A0A096LNJ9 63 aa4.65□□□□□ -1.66
SBNO1-201ENST00000267176 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.65□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 J3QKU1 62 aa4.65□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.65□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 BCE1O60756 84 aa4.65□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 COX17Q14061 63 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 C9orf85Q96MD7 179 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 Q6YL49 198 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 A6NED7 52 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 A0A087WVE0 104 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF580Q9UK33 172 aa4.64□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 PRR4Q16378 134 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 Q8N6K4 173 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 MUC7Q8TAX7 377 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 B9D2Q9BPU9 175 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 C19orf84I3L1E1 186 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 C4orf26Q17RF5 130 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.63□□□□□ -1.67
SBNO1-201ENST00000267176 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.1 ms