RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 MGAQ8IWI9 3026 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRS-201ENST00000262963 CENPEQ02224 2701 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 TIMM17BO60830 172 aa8.9□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 SYCNQ0VAF6 134 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 EDN2P20800 178 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 RNF183Q96D59 192 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 BPY2O14599 106 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 PRM2P04554 102 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 KRTAP10-9P60411 292 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 TRIAP1O43715 76 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 LELP1Q5T871 98 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 SZT2Q5T011 3432 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 C6orf99Q4VX62 202 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFA7O95182 113 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 BRI3O95415 125 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 ODF3L2Q3SX64 289 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 H0Y9J4 135 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRS-201ENST00000262963 A8MZ25 164 aa8.83□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 UBE2D3P61077 147 aa8.83□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 UBE2D2P62837 147 aa8.83□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF580Q9UK33 172 aa8.83□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.83□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.83□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 PLA2G2AP14555 144 aa8.83□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 A0A087WZ39 114 aa8.82□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 UBE2D1P51668 147 aa8.82□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 AGRNO00468 2067 aa8.82□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.82□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 SLPIP03973 132 aa8.81□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 UPK3BQ9BT76 320 aa8.81□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 IGIPA6NJ69 53 aa8.81□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 LAMA1P25391 3075 aa8.81□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.81□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 MUC7Q8TAX7 377 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 PTPRBP23467 1997 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 VCANP13611 3396 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 IGLV1-51P01701 117 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 J3KT08 172 aa8.79□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 C5orf47Q569G3 176 aa8.79□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 A0A096LNI7 61 aa8.79□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.78□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 ZNF292O60281 2723 aa8.78□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 M0R378 163 aa8.78□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.78□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 A0A096LNJ9 63 aa8.78□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 Q8IZM0 81 aa8.78□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 LST1O00453 97 aa8.78□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 MT-ATP8P03928 68 aa8.78□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.77□□□□□ -1
PTPRS-201ENST00000262963 COX17Q14061 63 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 Q6ZQY7 126 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 CCKP06307 115 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 C20orf197Q8N268 126 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 UQCRQO14949 82 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 IGKV2D-28P01615 120 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 SMR3AQ99954 134 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 IGKV4-1P06312 121 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 ENHOQ6UWT2 76 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRS-201ENST00000262963 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms