RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637083.1

CLN8-212, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-212ENST00000637083 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 A0A0J9YXY3 114 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 G3V4G9 280 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 H3BMG7 143 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 J3QR89 54 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 TSPAN13O95857 204 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 PF4P02776 101 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.7□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 NACAE9PAV3 2078 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 CFC1BP0CG36 223 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 CFC1P0CG37 223 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 UBE2D3P61077 147 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 UBE2D2P62837 147 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 HERVK_113P63121 156 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.69□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 A0A0B4J2C4 111 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 H7C423 109 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.68□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 A4D1N5 150 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 TMEM101Q96IK0 257 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 SPANXCQ9NY87 97 aa8.67□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 GAGE12JA6NER3 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 UBE2L6O14933 153 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 TIMM17BO60830 172 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 GAGE4Q13068 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 GAGE5Q13069 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 GAGE7O76087 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 SPINK8P0C7L1 97 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 GAGE12FP0CL80 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 GAGE12GP0CL81 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 GAGE12IP0CL82 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 INSL3P51460 131 aa8.66□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 LY6G6DO95868 133 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 PSMB2P49721 201 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 TMEM243Q9BU79 118 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 ERG28Q9UKR5 140 aa8.65□□□□□ -1.02
CLN8-212ENST00000637083 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 IFITM1P13164 125 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 WFDC2Q14508 124 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 RNF183Q96D59 192 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 JMJD1CQ15652 2540 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 PCP4P48539 62 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 COPS9Q8WXC6 57 aa8.64□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 NDUFA1O15239 70 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 PRSS2P07478 247 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 MIAQ16674 131 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 PRO0461Q9UI25 63 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 IGHV3-33P01772 117 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 KRTAP10-3P60369 221 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 LITAFQ99732 161 aa8.63□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.62□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 LINC00694P0DN24 101 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 Q1RN00 199 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 ETDBQ3ZM63 59 aa8.61□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 COX6A2Q02221 97 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 FHL2Q14192 279 aa8.6□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 TCL1BO95988 128 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 HERV-K104P63124 156 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 SFTA2Q6UW10 78 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.59□□□□□ -1.03
CLN8-212ENST00000637083 A8MZ25 164 aa8.58□□□□□ -1.04
CLN8-212ENST00000637083 COX6CP09669 75 aa8.58□□□□□ -1.04
CLN8-212ENST00000637083 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.58□□□□□ -1.04
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