RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.58□□□□□ -0.88
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C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PRX2 142 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.57□□□□□ -0.88
C9orf170-201ENST00000623052 TRIAP1O43715 76 aa9.57□□□□□ -0.88
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C9orf170-201ENST00000623052 SLC25A20O43772 301 aa9.56□□□□□ -0.88
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C9orf170-201ENST00000623052 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.54□□□□□ -0.88
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C9orf170-201ENST00000623052 TMEM86BQ8N661 226 aa9.53□□□□□ -0.88
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C9orf170-201ENST00000623052 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.52□□□□□ -0.89
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C9orf170-201ENST00000623052 JMJD1CQ15652 2540 aa9.52□□□□□ -0.89
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C9orf170-201ENST00000623052 ATXN8Q156A1 80 aa9.5□□□□□ -0.89
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.5□□□□□ -0.89
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C9orf170-201ENST00000623052 Q9H8V8 135 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf170-201ENST00000623052 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf170-201ENST00000623052 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE12JA6NER3 117 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE4Q13068 117 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE5Q13069 117 aa9.48□□□□□ -0.89
C9orf170-201ENST00000623052 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.47□□□□□ -0.89
C9orf170-201ENST00000623052 H7C423 109 aa9.47□□□□□ -0.89
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C9orf170-201ENST00000623052 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.47□□□□□ -0.89
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C9orf170-201ENST00000623052 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.46□□□□□ -0.89
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C9orf170-201ENST00000623052 LINC01006Q8NI28 216 aa9.46□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0U1RRA0 63 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 IFITM1P13164 125 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.45□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 LST1O00453 97 aa9.44□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 ACANP16112 2415 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE7O76087 117 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE12FP0CL80 117 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE12GP0CL81 117 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 GAGE12IP0CL82 117 aa9.43□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
C9orf170-201ENST00000623052 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.43□□□□□ -0.9
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