RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTH2Q96A98 100 aa8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0J9YXY3 114 aa8.46□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00694P0DN24 101 aa8.46□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX29Q8N6K0 151 aa8.46□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INSL3P51460 131 aa8.46□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS2P07478 247 aa8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPC2P61916 151 aa8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATRQ13535 2644 aa8.45□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL17DQ8TAD2 202 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE12JA6NER3 117 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2D3P61077 147 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2D2P62837 147 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX6A2Q02221 97 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE4Q13068 117 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE5Q13069 117 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.44□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCL1BO95988 128 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 J3QKU1 62 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE7O76087 117 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE12FP0CL80 117 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE12GP0CL81 117 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE12IP0CL82 117 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRYBA4P53673 196 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LITAFQ99732 161 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.43□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.42□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAND5Q8N907 189 aa8.42□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 K7EQD1 137 aa8.42□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV1-51P01701 117 aa8.42□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C16orf95Q9H693 158 aa8.42□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.42□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.41□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.41□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.41□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-33P01772 117 aa8.4□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.4□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0U1RRA0 63 aa8.4□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HILS1P60008 231 aa8.4□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP10-3P60369 221 aa8.4□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.4□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM101Q96IK0 257 aa8.4□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q1RN00 199 aa8.39□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.39□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERG28Q9UKR5 140 aa8.39□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIVEP1P15822 2718 aa8.38□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.37□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.37□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.37□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0B4J2C4 111 aa8.36□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.36□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C16orf74Q96GX8 76 aa8.36□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIRAPP58753 221 aa8.36□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.36□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.36□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.36□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q9H8V8 135 aa8.36□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.36□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXI1Q12951 378 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIAQ16674 131 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 J3QR89 54 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB130BP0DP73 79 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB130AP0DP74 79 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.35□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HERVK_113P63121 156 aa8.34□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9JAW5 83 aa8.34□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIAP1O43715 76 aa8.34□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PF4P02776 101 aa8.34□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.34□□□□□ -1.07
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