RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 ODF3Q96PU9 254 aa8.26□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 ORM2P19652 201 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 PRNTQ86SH4 94 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 BAALCQ8WXS3 180 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.25□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 IGLC6P0CF74 106 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TMEM101Q96IK0 257 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 RNF5Q99942 180 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 H3BT86 120 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 CRYGBP07316 175 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 MIFP14174 115 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 PDE6HQ13956 83 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 ATXN8Q156A1 80 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 RNF185Q96GF1 192 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 X6R8D5 127 aa8.23□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 A0A0B4J2C4 111 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 C9JAW5 83 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 FAM229AH3BQW9 127 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TNFRSF6BO95407 300 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 LAGE3Q14657 143 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.22□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TNXBP22105 4242 aa8.21□□□□□ -1.09
HCG18-241ENST00000602290 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SCGB2A1O75556 95 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 CRIP1P50238 77 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SGK494Q96LW2 274 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.21□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 A4D1N5 150 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 H3BMM0 161 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 IGKV1-16P04430 117 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 LINC00694P0DN24 101 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 CXCL5P42830 114 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 HERVK_113P61574 105 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 MLANAQ16655 118 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 UBE2WQ96B02 151 aa8.2□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 IGLV2-23P01705 113 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 APELAP0DMC3 54 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 CRYGAP11844 174 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP10-1P60331 282 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 C15orf32Q32M92 178 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 LINC01620Q4KN68 170 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.19□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 ZNF815PA8K554 130 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 H3BVH4 76 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SH2D1AO60880 128 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.18□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 A0A0J9YY99 117 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-30P01768 117 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 CFC1BP0CG36 223 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 CFC1P0CG37 223 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 PMVKQ15126 192 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZQT7 251 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 MUC2Q02817 5179 aa8.17□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.16□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 H3BRN7 92 aa8.16□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 IGHV3-33P01772 117 aa8.16□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 HERVK_113P63121 156 aa8.16□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.16□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 TOMM6Q96B49 74 aa8.16□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 F8W735 103 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
HCG18-241ENST00000602290 F8WDY8 70 aa8.15□□□□□ -1.1
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