RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 C7orf33Q8WU49 177 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 RNF185Q96GF1 192 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 A0A087WYN8 130 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GV50 99 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 PHOX2AO14813 284 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 MIAQ16674 131 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0J9YXV3 536 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 J3QR89 54 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 RAB5AP20339 215 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 MPV17L2Q567V2 206 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 PRNTQ86SH4 94 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 SCGB1C1Q8TD33 95 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 H3BVH4 76 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 TCRAP04437 139 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 CHTF8P0CG12 524 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 DEFA1P59665 94 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 DEFA3P59666 94 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2D3P61077 147 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2D2P62837 147 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 Q5BKY6 102 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 IL36BQ9NZH7 164 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 LPAP08519 4548 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0U1RQV1 116 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 hDV102S1A0JD36 115 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 SMKR1H3BMG3 65 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 LYRM1O43325 122 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP10-8P60410 259 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 REG3GQ6UW15 175 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 SVBPQ8N300 66 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 GTSF1Q8WW33 167 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM101Q96IK0 257 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 B4DEV8 164 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 C9JAW5 83 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 PLA2G10O15496 165 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 ATP6V0CP27449 155 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 PRR34Q9NV39 138 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 H0YIZ8 118 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 M0R381 172 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFC2O95298 119 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 SIX6O95475 246 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 MPC2O95563 127 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 APOC3P02656 99 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 FAM236CP0DP71 79 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 PMAIP1Q13794 54 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 Q75L30 129 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM18Q96B42 140 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 EPDR1Q9UM22 224 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 NTF3P20783 257 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 HSD52Q0P140 79 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 PEA15Q15121 130 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZVH6 145 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 KIR2DL4Q99706 377 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRM-210ENST00000578916 SLPIP03973 132 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 RASL11AQ6T310 242 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 CBLN2Q8IUK8 224 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.71□□□□□ -1.5
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