RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM101	Q96IK0	257 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1B0GUV1	79 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744		H7C423	109 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744		K7EP13	123 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	LECT2	O14960	151 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	NFE4	Q86UQ8	179 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM18	Q96B42	140 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744		Q0VG73	95 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	PMCHL1	Q16048	86 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	RMI2	Q96E14	147 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	WFDC2	Q14508	124 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	MIA	Q16674	131 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	BAALC	Q8WXS3	180 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	FAM104A	Q969W3	186 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	TM2D2	Q9BX73	214 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	BAGE3	Q86Y29	109 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		5.64	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744		A0A087WTM6	91 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744		A0A1B0GVY2	172 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	LINC01546	A6NGU7	62 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	IFITM10	A6NMD0	228 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	CCL25	O15444	150 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00614	P0C842	121 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	XCL1	P47992	114 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	TOMM6	Q96B49	74 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		5.63	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744		A0A096LNJ9	63 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744		K7EMI3	77 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	RAB5B	P61020	215 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	SS18	Q15532	418 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	TMEM141	Q96I45	108 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	PKD1	P98161	4303 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	IGIP	A6NJ69	53 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	EREG	O14944	169 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	SERF1A	O75920	110 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HBD	P02042	147 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00310	P59036	64 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	NUPR1	O60356	82 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H2BK	O60814	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H2BO	P23527	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H2BB	P33778	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H2BD	P58876	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H2BC	P62807	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	FOXI1	Q12951	378 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744		Q6ZN92	141 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		5.6	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	HSBP1	O75506	76 aa		5.59	□□□□□ -1.51
RPL4-208	ENST00000564744	G0S2	P27469	103 aa		5.59	□□□□□ -1.51

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