RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 A0A1B0GUV1 79 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 USP17L23D6RBM5 183 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 UBE2L6O14933 153 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 CTRLP40313 264 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 REG3AQ06141 175 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 COTL1Q14019 142 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 Q6ZSA8 131 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 GATD1Q8NB37 220 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.31□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 PRSS1P07477 247 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 AMTP48728 403 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 GTSF1Q8WW33 167 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 CNFNQ9BYD5 112 aa6.3□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 A0A1B0GV90 55 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 C20orf202A1L168 122 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 TCAPO15273 167 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 LINC00614P0C842 121 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 BORCS7Q96B45 105 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 OSTCQ9NRP0 149 aa6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 SCGB1D1O95968 90 aa6.28□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 PMCHP20382 165 aa6.28□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.28□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 SCXQ7RTU7 201 aa6.28□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.28□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 PRO1933Q9H354 126 aa6.28□□□□□ -1.4
INO80E-204ENST00000562291 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.27□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 CT83Q5H943 113 aa6.27□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.27□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.27□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.27□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 A0A1B0GUT8 65 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 hDV102S1A0JD36 115 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 I3L3M4 83 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 NCR2O95944 276 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 PMCHL1Q16048 86 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 TSKUQ8WUA8 353 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 DPH3Q96FX2 82 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 VAMP8Q9BV40 100 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 FAM231BA6NCW3 169 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 HIGD1CA8MV81 97 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 H7C423 109 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 J3QL48 77 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 APCSP02743 223 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 CFAP161Q6P656 301 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 ST20Q9HBF5 79 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.25□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.24□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 RIGQ13278 110 aa6.24□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.24□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.24□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.24□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 BAGE3Q86Y29 109 aa6.24□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 TMEM101Q96IK0 257 aa6.24□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.24□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.23□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 DLEU1O43261 78 aa6.23□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 GAS8-AS1O95177 125 aa6.23□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 FGF6P10767 208 aa6.23□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 RNF185Q96GF1 192 aa6.23□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 V9GYV3 84 aa6.23□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.22□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 AMN1Q8IY45 258 aa6.22□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 NUP35Q8NFH5 326 aa6.22□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 MRAP2Q96G30 205 aa6.22□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.22□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
INO80E-204ENST00000562291 FAT1Q14517 4588 aa6.21□□□□□ -1.42
INO80E-204ENST00000562291 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.21□□□□□ -1.42
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