RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547376.5

PTPRQ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRQ-201ENST00000547376 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
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PTPRQ-201ENST00000547376 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
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