RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545436.5

LMO3-232, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 530 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-232ENST00000545436 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 TMEM262E9PQX1 116 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 SIVA1O15304 175 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 TENM2Q9NT68 2774 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 RBX1P62877 108 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 SEC11AP67812 179 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 GAGE6Q13070 117 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 PMCHL1Q16048 86 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 TTC32Q5I0X7 151 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 AMELXQ99217 191 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 VCX2Q9H322 139 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 PMVKQ15126 192 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 PET117Q6UWS5 81 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 C20orf202A1L168 122 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 FABP4P15090 132 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 MPV17L2Q567V2 206 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 PRR34Q9NV39 138 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-232ENST00000545436 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 MIAQ16674 131 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 BAALCQ8WXS3 180 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 Q9H8V8 135 aa8.46□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 CRPP02741 224 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 PRSS1P07477 247 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.45□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 IFITM10A6NMD0 228 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 F8VRH5 84 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 Q6ZUT4 128 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 RMI2Q96E14 147 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 CST9LQ9H4G1 147 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 COX11Q9Y6N1 276 aa8.44□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 C3orf79P0CE67 100 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 PLNP26678 52 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 REG3AQ06141 175 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 LINC01545Q5VT33 79 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 Q8N976 141 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 FAM104AQ969W3 186 aa8.43□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 UBE2D1P51668 147 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 HERVK_113P63121 156 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 ODF1Q14990 250 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 SS18Q15532 418 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.42□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 KRTDAPP60985 99 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 NFE4Q86UQ8 179 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 KLK12Q9UKR0 248 aa8.41□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 IGHV3-30P01768 117 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 IGHV3-33P01772 117 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 IGLC3P0DOY3 106 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.4□□□□□ -1.06
LMO3-232ENST00000545436 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 DPM2O94777 84 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 LYSTQ99698 3801 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 TM2D2Q9BX73 214 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.39□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 H3BRM9 83 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 UBE2WQ96B02 151 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 IGKCP01834 107 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 ENHOQ6UWT2 76 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-232ENST00000545436 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms