RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.17□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.17□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZUT4 128 aa8.17□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.17□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.17□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-30P01768 117 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-33P01772 117 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 Q8N976 141 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 VCX2Q9H322 139 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 Q9H8V8 135 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.16□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 IFITM10A6NMD0 228 aa8.15□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 K7EP13 123 aa8.15□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 PRSS1P07477 247 aa8.15□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 PMVKQ15126 192 aa8.15□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.15□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.15□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 BAALCQ8WXS3 180 aa8.15□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.15□□□□□ -1.1
LMO3-218ENST00000538020 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.14□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 AMELXQ99217 191 aa8.14□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.13□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.13□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 CRPP02741 224 aa8.13□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 KRTDAPP60985 99 aa8.13□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 TTC32Q5I0X7 151 aa8.13□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 Q8N3U1 123 aa8.13□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 KLK12Q9UKR0 248 aa8.13□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 H0Y8G0 127 aa8.12□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.12□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 C3orf79P0CE67 100 aa8.12□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 PET117Q6UWS5 81 aa8.12□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.12□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.12□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 FAM104AQ969W3 186 aa8.12□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 CST9LQ9H4G1 147 aa8.12□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 C20orf202A1L168 122 aa8.11□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.11□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 CCL25O15444 150 aa8.11□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 REG3AQ06141 175 aa8.11□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.11□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.11□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 PRR34Q9NV39 138 aa8.11□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.1□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.1□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.1□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 LY6G6CO95867 125 aa8.1□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 AKR1D1P51857 326 aa8.1□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 SEC11AP67812 179 aa8.1□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 SS18Q15532 418 aa8.1□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 MIAQ16674 131 aa8.1□□□□□ -1.11
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LMO3-218ENST00000538020 UBE2WQ96B02 151 aa8.1□□□□□ -1.11
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LMO3-218ENST00000538020 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.09□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 F8VRH5 84 aa8.09□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 UBE2D1P51668 147 aa8.09□□□□□ -1.11
LMO3-218ENST00000538020 ODF1Q14990 250 aa8.09□□□□□ -1.11
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LMO3-218ENST00000538020 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.08□□□□□ -1.12
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LMO3-218ENST00000538020 LINC01545Q5VT33 79 aa8.08□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 ENHOQ6UWT2 76 aa8.08□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.08□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 RMI2Q96E14 147 aa8.08□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.07□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 IGLC3P0DOY3 106 aa8.07□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 PLNP26678 52 aa8.07□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 HERVK_113P63121 156 aa8.07□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 A0A0J9YXV3 536 aa8.06□□□□□ -1.12
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LMO3-218ENST00000538020 NFE4Q86UQ8 179 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.06□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 TENM2Q9NT68 2774 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 SCGB1D1O95968 90 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 IGKCP01834 107 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 Q9HAA7 133 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 COX11Q9Y6N1 276 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 LYSTQ99698 3801 aa8.05□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.04□□□□□ -1.12
LMO3-218ENST00000538020 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.04□□□□□ -1.12
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