RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 TMEM89A2RUT3 159 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 A8MWV9 139 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 TMEM262E9PQX1 116 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 M0QY20 66 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 M0R2P5 195 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 GNRH2O43555 120 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 Q6Q795 121 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 FAM159AQ6UWV7 190 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.81□□□□□ -1.96
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SGCE-211ENST00000522045 CITED1Q99966 193 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa2.81□□□□□ -1.96
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SGCE-211ENST00000522045 ZNF702PQ9H963 129 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 SPANXCQ9NY87 97 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 ROS1P08922 2347 aa2.81□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 ZFHX4Q86UP3 3567 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 POLEQ07864 2286 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.8□□□□□ -1.96
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SGCE-211ENST00000522045 TIMM17BO60830 172 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 MT-ATP8P03928 68 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 ZNF688P0C7X2 276 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
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SGCE-211ENST00000522045 DEFB1P60022 68 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 CKS1BP61024 79 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 RPL39P62891 51 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 CFAP161Q6P656 301 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 C20orf203Q8NBC4 194 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 PTH2Q96A98 100 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 MUC3AQ02505 3323 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 LOC400499M0QZD8 3231 aa2.8□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.79□□□□□ -1.96
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SGCE-211ENST00000522045 A0A0J9YXY3 114 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.79□□□□□ -1.96
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SGCE-211ENST00000522045 H3BT86 120 aa2.79□□□□□ -1.96
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SGCE-211ENST00000522045 SPINK8P0C7L1 97 aa2.79□□□□□ -1.96
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SGCE-211ENST00000522045 ATXN8Q156A1 80 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 LINC01620Q4KN68 170 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 C10orf105Q8TEF2 133 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.79□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 Q9HAA7 133 aa2.79□□□□□ -1.96
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SGCE-211ENST00000522045 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 BDP1A6H8Y1 2624 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 DSPP15924 2871 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 H3BUX3 64 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-11P01762 117 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 IFITM1P13164 125 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 EMP1P54849 157 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 ZNF56Q15929 161 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 MIAQ16674 131 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 LINC00527Q9UJ94 153 aa2.78□□□□□ -1.96
SGCE-211ENST00000522045 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 A0A0J9YXV3 536 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 C9JAW5 83 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 H3BMM0 161 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 LST1O00453 97 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 MSMBP08118 114 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 CD28P10747 220 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 BRD3OSQ6XYD6 125 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 TMEM61Q8N0U2 210 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 UBE2WQ96B02 151 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 CHCHD7Q9BUK0 85 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 PRORYQ9H606 182 aa2.77□□□□□ -1.97
SGCE-211ENST00000522045 ICOSQ9Y6W8 199 aa2.77□□□□□ -1.97
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