RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	HMGN4	O00479	90 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	GNG11	P61952	73 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		0.36	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	LRP6	O75581	1613 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF815P	A8K554	130 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	SPINK8	P0C7L1	97 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	SNCA	P37840	140 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	COX6A2	Q02221	97 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	HSD52	Q0P140	79 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188		Q5VV11	94 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	C12orf57	Q99622	126 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF609	O15014	1411 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		0.35	□□□□□ -2.35
RNF146-208	ENST00000495188	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188		F8VRH5	84 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	HAMP	P81172	84 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	BAGE2	Q86Y30	109 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	C14orf144	Q96I85	54 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	F8	P00451	2351 aa		0.34	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188		Q0VG73	95 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	SFTA2	Q6UW10	78 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	AMELX	Q99217	191 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	CGREF1	Q99674	301 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	LAMC1	P11047	1609 aa		0.33	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	IGF2R	P11717	2491 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TSC2	P49815	1807 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	UQCR11	O14957	56 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	PIN1P1	O15428	100 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	APOC3	P02656	99 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	MYH4	Q9Y623	1939 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		0.32	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM218	A2RU14	115 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188		M0R3E3	92 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	SFT2D2	O95562	160 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	RBP2	P50120	134 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	S100A10	P60903	97 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	COX17	Q14061	63 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188		Q6JHZ5	121 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	HMGXB3	Q12766	1538 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	POLQ	O75417	2590 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		0.31	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	COL4A6	Q14031	1691 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	USF3	Q68DE3	2245 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	hADV29S1	A0JD25	119 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM262	E9PQX1	116 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	BCE1	O60756	84 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	SPINK1	P00995	79 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	IGLC1	P0CG04	106 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	PRO0255	Q9UI72	69 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	ABCC5	O15440	1437 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		0.3	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		0.29	□□□□□ -2.36
RNF146-208	ENST00000495188	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		0.29	□□□□□ -2.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.7 ms