RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC10-211ENST00000485621 VPS25Q9BRG1 176 aa2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC10-211ENST00000485621 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM167BQ9NRX6 74 aa2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC10-211ENST00000485621 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.78□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 C7orf77A4D0Y5 90 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 M0R2N4 97 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCL25O15444 150 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BKO60814 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 LTAP01374 205 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGLV2-8P01709 118 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BJP06899 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 PFN1P07737 140 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TPT1P13693 172 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BOP23527 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BBP33778 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 AKR1C3P42330 323 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 CSN1S1P47710 185 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 CRYBA4P53673 196 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BDP58876 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BCP62807 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR5I1Q13606 314 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST2H2BEQ16778 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 ESRGQ1W209 222 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 LGALS9BQ3B8N2 356 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 C15orf53Q8NAA6 179 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BHQ93079 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 IMMP2LQ96T52 175 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BNQ99877 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIST1H2BMQ99879 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 DERL1Q9BUN8 251 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRO1933Q9H354 126 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.77□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 PKD1P98161 4303 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 DNAH2Q9P225 4427 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV21A0A0B4J279 112 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 UMAD1C9J7I0 102 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 H3BNG1 76 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 RS1O15537 224 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 SH2D1AO60880 128 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TSPAN13O95857 204 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 SMIM17P0DL12 118 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 P0DMU3 169 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM231AP0DMU4 169 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM231CP0DMU5 169 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00694P0DN24 101 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM159AQ6UWV7 190 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 FMC1Q96HJ9 113 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 UPK3BQ9BT76 320 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 CST9LQ9H4G1 147 aa2.76□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 PKHD1P08F94 4074 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV4A0A0B4J268 109 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 B4DEV8 164 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 H3BVH4 76 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 M0R036 132 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 M0R2P5 195 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 NDUFA6P56556 154 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HERVK_113P61574 105 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 CFAP126Q5VTH2 177 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 TEX43Q6ZNM6 134 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 NIT1Q86X76 327 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 WFDC10BQ8IUB3 73 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 PTH2Q96A98 100 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 SFRP2Q96HF1 295 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 SAMD10Q9BYL1 202 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.75□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 HERC2O95714 4834 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A0J9YXY3 114 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 C9JCJ5 164 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 K7EQM0 130 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 CRYGDP07320 174 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 BCL2P10415 239 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 FABP4P15090 132 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 CTRLP40313 264 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 LYPD5Q6UWN5 251 aa2.74□□□□□ -1.97
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms